国家林业局948项目(2006-4-80)
- 作品数：3 被引量：61H指数：3
- 相关作者：杨彦伶张亚东张新叶宋丛文黄敏仁更多>>
- 相关机构：湖北省林业科学研究院南京林业大学更多>>
- 发文基金：引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 基于EST序列的杨树候选SNPs标记分析被引量：4
- 2009年
- 利用生物信息学方法对来自2个不同cDNA文库的2万余条杨树EST序列进行了候选SNPs标记。研究结果表明,在获得的94个碱基替代型候选SNPs中,A/G替换类型最多,占32.98%,C/T替换型占13.83%,其它碱基置换型SNPs占53.20%。同时,对其中20个候选SNPs位点的重新测序结果表明,有13个(占65%)候选SNPs位点得到证实,其中,11个位点为碱基替代型SNPs,另外2个为杂合型位点。
- 张新叶宋丛文杨彦伶张亚东黄敏仁
- 关键词：单核苷酸多态性表达序列标签杨树
- 杨树SSR标记在柳树中的通用性分析被引量：25
- 2008年
- 简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记因其具有稳定性好、多等位基因、共显性遗传、数量丰富、基因组覆盖性好等优点,现已广泛应用于多种植物的遗传育种研究中。本研究利用杨树的48对基因组SSR引物及48对EST-SSR引物对6个苏柳品种进行了通用性分析。结果表明,杨树EST-SSR引物在柳树中的通用性达54.2%,而基因组SSR的通用性仅10.4%;但EST-SSR引物在有效引物中的多态性比例为80%,基因组SSR引物在有效引物中的多态性比例为100%。同时研究结果也表明,杨树SSR标记完全可以用于柳树群体或品种间的群传多样性分析。
- 杨彦伶张亚东张新叶
- 关键词：杨树SSR柳树
- 杨树感抗黑斑病叶片EST序列测定及相关基因表达谱分析
- 杨叶黑斑病是杨树的主要病害之一,受害杨树光合效率下降并提早落叶,严重影响树木生长。EST技术作为发现新基因和基因表达谱研究的有力工具,受到全世界重视。本研究利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨...
- 张新叶宋丛文黄敏仁
- 关键词：杨树表达序列标签
- 文献传递
- 杨树EST-SSR标记的开发被引量：35
- 2009年
- 利用来自美洲黑杨及欧美杨的20023条EST序列,进行EST-SSR标记开发研究。首先对这些EST序列进行序列拼接,然后在非重复序列中发现由二核苷酸至五核苷酸组成的SSR重复序列。共在10816个非重复序列中发现1604个序列含有SSR,占总非重复序列的14.8%。在发现的1918个SSR重复序列中,二核苷酸重复是最丰富的重复类型,占总类型的62.3%。设计合成48对SSR引物,利用6个不同的杨树品种对其进行验证。结果约90%的引物获得扩增产物,58%的引物在6个不同杨树品种中产生多态性分离。另外,还对重复序列的数量及重复类型进行了讨论。
- 张新叶宋丛文张亚东杨彦伶黄敏仁
- 关键词：杨树
