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广西研究生教育创新计划(20101059810021d214)
作品数:
1
被引量:6
H指数:1
相关作者:
黎丹戎
郭亚
朱小东
张玮
曲颂
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相关机构:
广西医科大学附属肿瘤医院
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发文基金:
国家自然科学基金
广西研究生教育创新计划
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相关领域:
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2012
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应用蛋白质的相互作用网络图筛选鼻咽癌放射抗拒相关基因
被引量:6
2012年
目的应用蛋白质相互作用网络图,寻找鼻咽癌放射抗拒相关的分子标志物,探讨鼻咽癌放射抗拒机制。方法应用全基因组表达谱芯片,初步筛选出2种不同放射敏感性细胞株CNE-2R与CNE-2的差异表达基因。采用计算机软件随机选取4个差异表达基因,分别设计引物,用半定量RT—PCR技术检测验证。将2次实验中均出现的差异有统计学意义的基因导入SNOW在线数据库进行分析,绘制差异基因相互作用网络图,网络中心节点作为鼻咽癌放射抗拒相关分子标志物;进一步采用Westernblot检测关键节点STAT1在CNE-2R与CNE-2表达差异。结果CNE-2R与CNE-2相比,2次芯片实验中均出现的差异基因374个,其中差异有统计学意义的基因197个;随机选取的4个差异表达基因RT—PCR结果与芯片扫描结果相似,具有相同的方向性。197个共有的差异有统计学意义的基因编码蛋白经SNOW分析存在相互作用,并构成一个复杂的相互作用网络图,寻找到了关键性的节点为STAT1和JUN。Westernblot结果显示,STAT1-α在CNE-2R中表达明显高于CNE-2(t=4.96,P〈0.05)。结论关键性的节点STAT1和JUN可能是引起鼻咽癌放射抗拒的分子标志物,STAT1-α可能与鼻咽癌放射抗拒发生密切相关。
朱小东
郭亚
曲颂
李龄
黄诗婷
黎丹戎
张玮
关键词:
鼻咽癌
放射抗拒
基因芯片
蛋白质相互作用网络
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