广东省医学科学技术研究基金(A2009550)
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 相关作者：陈伟烈魏绍静唐漾波袁小珍唐小平更多>>
- 相关机构：广州市第八人民医院更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 长期不进展人类免疫缺陷病毒-1感染者准种膜蛋白V3环氨基酸特点分析被引量：1
- 2010年
- 目的 了解长期不进展HIV-1感染者HIV-1准种膜蛋白V3环氨基酸序列特征及变异特点.方法 应用终点有限稀释套式PCR方法,对5例长期不进展HIV-1感染者不同时间点单个HIV-1前病毒env基因c2-v3-c3区域进行扩增和序列测定,用序列确证分析技术分析env基因区V3环氨基酸序列特征.结果 5例患者不同随访时间点获得的准种序列中,V3环35个氨基酸中出现多样性的位点分别有1～10个不等,同一患者不同随访时间点准种优势株序列完全一致或仅有1～2个位点不同;4例患者V3环顶端四肽为GPGR,1例患者为GPGK,同一患者不同随访时间点V3环顶端四肽一致;根据V3环11和25位氨基酸及V3环的电荷推测HIV-1辅助受体均为趋化因子受体（CCR）5.结论 长期不进展HIV-1感染者V3环序列存在不同程度变异,顶端四肽稳定性高,感染的HIV-1毒株可能为非合胞体诱导型毒株.
- 陈伟烈唐小平唐漾波魏绍静
- 关键词：HIV-1病毒包膜蛋白质类氨基酸类
- 实时荧光PCR技术在丙型肝炎病毒基因型检测中的应用被引量：5
- 2011年
- 目的探讨实时荧光PCR技术在丙型肝炎病毒(HCV)基因型检测中的应用价值。方法采用一步法逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)结合TaqMan技术,对HCV基因型进行实时荧光PCR检测;巢式RT-PCR扩增HCV的NS5B基因区域,测序后进行HCV基因亚型分析并与实时荧光PCR分型结果进行比较。结果实时荧光PCR共分型119例,1型71例(59.7%),非1型48例(40.3%)其中110例成功进行测序分型;测序分型的110例中,1型73例(均为1b型),占66.4%,非1型37例(其中2a型7例、3a型6例、3b型3例、4a型1例、4k型1例、5a型1例、6a型17例、6n型1例),占33.6%。与110例测序分型的结果比较,实时荧光PCR分型总的符合率为71.8%(79/110),其中1型的符合率为80.9%(55/68),非1型的符合率为57.1%(24/42)。结论实时荧光PCR进行HCV基因型检测操作简便、快速,但分型结果特异性不高。
- 袁小珍陈伟烈魏绍静唐漾波
- 关键词：实时荧光PCR基因测序丙型肝炎病毒基因型
