贵州省重大科技专项计划项目(无)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：杨永强惠嫣婷刘若余赵顺林肖希希更多>>
- 相关机构：贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室更多>>
- 发文基金：贵州省重大科技专项计划项目贵州省科技厅重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率被引量：2
- 2012年
- 目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回收后对PCR产物进行双向测序。结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区。贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.000 0,而务川黑牛分别为0.673 0和0.810 6。生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs。
- 杨永强焦仁刚龚俞惠嫣婷刘若余
- 关键词：SNPSJAK/STAT
- 不同牛种STAT5B基因启动子多态性分析
- 2012年
- 目的:试验旨在筛选STAT5B基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果:STAT5B基因5'调控区及第1外显子存在3个SNPs位点,分别为:T-181C、C-31G、T+119C。生物信息学软件预测得到STAT5B基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNP位点导致5个转录因子结合位点消失,而产生8个新的转录因子结合位点。软件未发现可能的CpG岛范围,但STAT5B基因RNA二级结构和最小自由能在突变后显著改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,STAT5B启动子区存在功能性SNP位点。
- 赵顺林杨永强龚俞焦仁刚惠嫣婷谢海强肖希希肖超能刘若余
- 关键词：STAT5B启动子
