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国家自然科学基金(30571331)

作品数:4 被引量:5H指数:2
相关作者:蒋曹德杨宗林李跃民石萍董然然更多>>
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相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 4篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 3篇农业科学
  • 2篇生物学

主题

  • 2篇印记
  • 2篇组织表达分析
  • 2篇PIG
  • 2篇PORCIN...
  • 1篇蛋白质二级结...
  • 1篇信息熵
  • 1篇性能评价
  • 1篇选择性剪接
  • 1篇印记基因
  • 1篇染色
  • 1篇染色体
  • 1篇染色体定位
  • 1篇相对熵
  • 1篇克隆
  • 1篇互信息
  • 1篇基因
  • 1篇剪接
  • 1篇CHARAC...
  • 1篇DLK1
  • 1篇DURING

机构

  • 3篇西南大学

作者

  • 2篇蒋曹德
  • 1篇杨应斌
  • 1篇于淑惠
  • 1篇田家伟
  • 1篇李跃民
  • 1篇魏晋
  • 1篇杨宗林
  • 1篇李顺
  • 1篇董然然
  • 1篇石萍

传媒

  • 2篇西南大学学报...
  • 1篇中国农业科学
  • 1篇Agricu...
  • 1篇第四届中国畜...

年份

  • 1篇2010
  • 3篇2009
  • 1篇2008
4 条 记 录,以下是 1-5
排序方式:
猪COPG2和MEST克隆、印记状况和组织表达分析被引量:1
2010年
【目的】为了在猪中找到更多新的候选印记基因并分析它们在哺乳动物之间的保守性,以期为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息和分子标记。【方法】以长白与荣昌猪杂交F1代一月龄个体为研究对象,通过比较生物学的方法,克隆COPG2和MEST全长cDNA,并分析基因的序列特点,然后利用IMpRH(法国农业科学院的辐射杂种克隆板)分析COPG2和MEST在猪染色体上定位信息。通过RT-PCR产物直接测序方法分析了这些基因在一月龄F1代个体11个不同组织(心、胃、肌肉、肾脏、肺、肝、小肠、膀胱、舌头、脾和脂肪)的印记状况,并进一步利用Real-timePCR方法,分析其在一月龄F1代个体11个不同组织的表达情况。【结果】克隆得到2817bp COPG2和2219bp MEST序列。其中COPG2包括2616bp完整CDS(coding sequenc,编码序列)区域,分析表明其编码含871个氨基酸的蛋白质,MEST包括981bp完整CDS区域,编码326个氨基酸的蛋白质。IMpRH分析结果表明,猪COPG2和MEST都位于猪18号染色体上并且与标记CL365941紧密连锁,LOD值分别为14.32和8.5。印记分析表明COPG2在11个组织中呈双等位表达,MEST在心脏、胃、肌肉、肾、肺、膀胱、舌头和脂肪中表达父方等位基因,但在肝脏、小肠和脾脏中呈双等位表达。荧光定量结果显示COPG2和MEST总的表达量在一月龄个体各组织间存在着显著性差异(P<0.01),其中COPG2和MEST在肾脏中表达量均高于其它各组织(P<0.01)。【结论】在哺乳动物之间,COPG2序列较为保守但是印记状况却缺乏保守性;MEST序列和印记状况均较为保守,但MEST在猪中印记状况具有组织特异性。此外,染色体定位信息和印记状况证实了在猪的18号染色体上有由COPG2和MEST构成的新的印记域。
李顺蒋曹德石萍董然然魏晋田家伟
关键词:克隆染色体定位
Characterization,Imprinting Status and Tissue Distribution of Porcine GTL2 Gene被引量:2
2009年
The callipyge (CLPG) phenotype, exhibiting polar overdominance (POD), is an inherited skeletal muscle hypertrophy described in sheep. The callipyge locus maps to the distal portion of ovine chromosome 18 within the DLKI-GTL2 region and corresponds to human chromosome 14 and mouse chromosome 12. The POD phenomenon is confirmed to the homologous region of swine chromosome 7. In order to clone and investigate the expression of porcine GTL2 gene, DNA and RNA samples from 60-day-old F1 animals, generated with reciprocal crosses between Large White and Meishan breeds and their parents, were used. The authors showed that porcine GTL2 acted as a uoncoding RNA. cDNA samples exhibited maternal expression of the gene in the heart, liver, spleen, lung, kidney, stomach, small intestine, skeletal muscle, and fat in pigs, and a unique tissue-specific expression different from that of humans and mice. These results indicated that the gene was conserved in the pig, human, mouse, and bovine. It will be of interest to further study the gene functions in muscle growth and fat deposition.
JIANG Cao-de YANG Zong-lin
关键词:PIG
猪DLK1基因序列特征、印记状况及组织表达分析被引量:2
2009年
提取了2月龄大白猪、梅山猪及其正反交F1代个体的DNA或RNA样品,采用RT-PCR、SNP和相对定量分析的方法研究了猪DLK1基因的不同剪接体,印记状况和组织特异性表达谱.结果表明:猪DLK1氨基酸具有糖基化位点,表皮生长因子重复结构特征和delta/notch/serrate信号分子家族高度相关的二级结构,并且与其他哺乳动物的氨基酸序列具有高度同源性;在2月龄猪的心脏、肝脏、脾脏、肺、肾、胃、舌头、小肠、骨骼肌和脂肪组织中除了表达DLK1-B和DLK1-C2外,还发现了新的剪接体DLK1-A,并且3种剪接体在所检测的组织中均只表达父源的等位基因;DLK1基因总的表达量在各组织中存在显著性差异(p<0.01),其中骨骼肌和肺表达量最高,其次是舌、脾和脂肪,心脏和肝脏最低(p<0.05).因此,DLK1基因在哺乳动物间高度保守;猪在生长发育的各个阶段主要表达DLK1-C2剪接体,在某阶段也表达DLK1-A或DLK1-B;DLK1基因在猪生长发育的不同阶段和不同组织中只表达父源等位基因,并且对猪各个组织生长发育起着必要的作用,但总的表达量在不同生长发育时期组织中存在差异.
杨宗林蒋曹德李跃民
关键词:印记基因DLK1选择性剪接
基于信息熵的蛋白质二级结构预测算法的准确性研究
2008年
通过分析信息熵的概念内涵,提出基于信息熵的蛋白质二级结构预测算法的准确性评价方法,与现有方法相比,这种方法更全面,不仅能确定假阳性率,假阴性率,还能确定预测值与实际值之间的不确定性的减少量即预测值与实际值之间的互信息.
于淑惠杨应斌
关键词:性能评价信息熵相对熵互信息蛋白质二级结构
Monoallelic Expression Analysis of Porcine RTL1 and DIO3 Genes During Postnatal Development
pression patterns and functional roles of protein-coding genes in the Dlk1-Dio3 imprinted domain have been ext...
Jiang-caodeShi-pingLi-shunLuo-shuang
关键词:GENESPIG
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