国家自然科学基金(30600487)
- 作品数：2 被引量：28H指数：2
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- 好氧异养硝化菌Acinetobacter sp. YY-5的分离鉴定及脱氮机理被引量：26
- 2009年
- 通过异养硝化培养基获得一株高效脱氮细菌,并通过形态学特征、生理生化反应及16S rDNA同源性比较对筛得菌株进行了鉴定;分别以NO3--N和NO2--N为唯一氮源,通过对脱氮过程中各种含氮代谢物的定量及对脱氮相关基因氨单加氧酶基因(amoA)、羟胺氧化酶基因(hao)、周质硝酸盐还原酶亚基基因(napA)的扩增及测序比较,对该菌株的生理途径及脱氮机理进行了研究.结果表明,高效脱氮细菌YY-5不能发生好氧反硝化,但能在3d内将氨氮由95.23mg/L降解至1.29mg/L,降解率达到98.6%,同时未发现亚硝酸盐氮、硝酸盐氮积累;对该菌主要代谢气体产物进行检测,发现CO2和N2明显增多,无N2O生成;经鉴定,初步判定该菌为不动杆菌属,命名为Acinetobacter sp. YY-5;从该菌基因组中均能扩增出amoA、hao、napA等基因,其中napA与hao基因与已报道的napA与hao基因进行Blast比较,发现具有较大差别.
- 金敏王景峰孔庆鑫赵祖国王新为谌志强陈照立邱志刚李君文
- 关键词：ACINETOBACTER脱氮
- 一种羟胺氧化酶基因序列的PCR扩增及其生物信息学分析被引量：2
- 2009年
- 采用PCR法获得不动杆菌Acinetobactor sp.YY-5的一种羟胺氧化酶(Hydroxylamine oxidored uctase,HAO)编码基因序列并进行生物信息学分析.根据自养菌的HAO基因序列保守区设计4对引物,通过RT-PCR获得预期大小的部分序列,再采用Genome walking PCR法向所得的部分序列两侧延伸;对所得序列在NCBI中进行blast分析,并用FGeneSB进行开放读码框(Open read frame,ORF)预测.结果表明,RT-PCR获得了一段462bp的序列,通过Genome walking PCR向两侧延伸后,获得了一段3152bp长的序列;ORF预测结果显示所得序列可能有4个ORF,RT-PCR获得的462bp序列所在ORF长555bp,对应氨基酸序列相对分子质量(Mr)大小为20.2×103;在Gene bank中进行的Blast比对分析显示,除保守区的引物序列外,未发现有与此ORF存在明显相似性的HAO基因,表明这可能是一种新型羟胺氧化酶基因.
- 赵祖国孔庆鑫王景峰金敏王新为李君文
- 关键词：不动杆菌生物信息学生物脱氮基因序列开放读码框
