福建省科技计划项目(2001Z026)
- 作品数：4 被引量：18H指数：2
- 相关作者：郑伟文郑斯平陈彬李友发宋兵更多>>
- 相关机构：福建省农业科学院福建农林大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 福建省稻田土壤细菌群落的16S rDNA-PCR-DGGE分析被引量：17
- 2008年
- 用不依赖细菌培养的16S rDNA-PCR-DGGE方法对福建省6个不同地区12个取样点的稻田土壤进行细菌群落结构分析。对12份样品直接提取其总DNA,用F341GC/R534引物扩增16S rDNA基因的V3可变区,结合DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)技术分析样品细菌群落组成。结果表明,福建省不同地区的稻田土壤之间细菌群落结构存在较大差异,大体上可分为闽东、闽南、闽北、闽西4个大类。同一地区的根际土和表土样品之间也存在差异,但差异相对较低,其中龙岩根际土和表土细菌群落结构相似性最大,永泰差异性最大。回收了DGGE图谱中11个条带,测序结果经过Blast比对表明其中10个条带代表的细菌是不可培养的,显示了DGGE技术的优越性。
- 李友发宋兵宋亚娜郑斯平翟焕趁郑伟文
- 关键词：稻田土壤细菌群落
- 特色农业微生物基因组研究系统的建立
- 2010年
- 以Web形式在LAMP(Linux+Apache+MySQL+PHP)环境下,建立以特色细菌菌株为主体的农业微生物基因组数据库和计算机工作平台,充分利用业已公布的生物基因组序列信息和技术平台,揭示特色农业微生物基因的结构功能,提供有自主知识产权意义的DNA序列等生物信息。
- 郑斯平陈彬宋亚娜关雄郑伟文
- 关键词：生物信息学微生物基因组数据库
- 稻田固氮细菌分离物的PCR-DGGE及其序列同源性分析被引量：2
- 2007年
- 采用PCR-DGGE法对从福建稻田取得的8个固氮细菌分离物进行分子鉴定,通过测序比对,发现它们与中慢生根瘤菌(Mesorhizobiumsp.)、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonassp.)、根瘤菌(Rhizobiumsp.)、慢生根瘤菌(Bradyrhizobiumsp.)、克雷伯氏杆菌(Klebsiellasp.)、伯克霍德尔氏菌(Burkholderia cepacia)、假单胞菌(Pseud-omonassp.)、诺卡氏菌(Nocardioides)和红球菌(Rhodococcussp.)9个属的固氮细菌具有高度同源性。
- 宋兵李友发林智敏陈彬郑伟文
- 关键词：水稻土固氮细菌
- 蓝细菌与福建苏铁(Cycad revoluta)的侵染性重组的研究被引量：1
- 2007年
- 将苏铁珊瑚状根及根周围的土壤中分离的蓝细菌分离物与福建苏铁(Cycas revoluta)在实验室条件下进行重组。通过比较重组前后蓝细菌分离物的STRR指纹图谱和16S rRNA的序列得蓝细菌分离物RZHA4能重新侵染苏铁的珊瑚状根。通过NCBI比对,蓝细菌分离物RZHA4的16S rRNA序列与蓝细菌NostocaceaeIL13-1的相似性为99%。
- 陈彬郑斯平郑伟文
- 关键词：蓝细菌RRNA
