上海市卫生局青年科研基金(2010Y105)
- 作品数：3 被引量：24H指数：2
- 相关作者：陈洪友陈敏宋元君屠丽红张曦更多>>
- 相关机构：上海市疾病预防控制中心上海健康医学院更多>>
- 发文基金：上海市卫生局青年科研基金国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 用于脉冲场凝胶电泳指纹图谱分析的分区条带计数法的建立被引量：1
- 2014年
- [目的]建立操作简便、软件依赖性低、结果易于交流的脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱分析新方法。[方法]按PulseNet标准操作规程,对44株副溶血性弧菌进行PFGE分型试验,分别利用分区条带计数法和BioNumerics软件对图谱进行分析,并以型别数、成簇数和Simpson’s多样性指数(DI)对2种分析方法进行比较。[结果]分区条带计数法可将44株菌分为32个型(DI=97.6%),能发现5簇。BioNumerics聚类分析可分为29个BN型(DI=95.5%),能发现4簇。在发现菌株成簇的能力上,2种分析方法的差异无统计学意义。[结论]条带计数法能大大减少肉眼观察的图谱数量,具有操作简便、成本低、对软件依赖性小、结果显示简单直接的特点,能直观反映菌株条带的分布特征,因此应能满足分型信息共享与交流的要求。
- 陈洪友屠丽红陈敏宋元君张曦
- 关键词：分子分型指纹图谱脉冲场凝胶电泳
- 贝类水产中副溶血性弧菌菌型分布研究被引量：8
- 2014年
- 目的了解贝类水产中副溶血性弧菌(VP)的菌型构成及其特点。方法按照GB/T 4789.7标准处理贝类标本,每份VP阳性标本挑取10个克隆,并对其进行血清分型,以PCR法检测tdh、trh、GS-PCR和f237噬菌体的携带情况,并据此对阳性标本中的VP进行菌型区分,分析各菌型在相应标本中的构成。结果 75份贝类水产中18份(24.0%)检出VP,5.6%携带trh阳性VP(O4∶KUT),未检出tdh阳性菌株。18份VP阳性标本共获得180株VP克隆,共可分为42种菌型。检出3株O3∶K6和1株O1∶K33 GS-PCR阳性菌株,均为非流行株。不同标本中菌型数不完全相同,最多可检出9种,平均每份VP阳性标本含6.1种菌型。检出47个(26.1%)克隆株携带f237的orf8完全缺失变种。结论 f237 orf8完全缺失变种噬菌体在贝类中具有广泛的分布。贝类中VP种群构成复杂,常携带多个菌型。临床常见菌型在贝类中不具优势,食品中VP的检测应充分考虑血清分型、基因分型的作用。
- 陈洪友屠丽红陈敏宋元君王文静
- 关键词：副溶血性弧菌血清型TDHTRH食源性疾病
- 2012年上海地区副溶血性弧菌血清分型和毒力基因携带状况研究被引量：16
- 2014年
- 为了解2012年上海地区副溶血性弧菌人源株和食源株的优势血清型及其毒力基因携带状况，本研究收集了2012年从上海市15个区（县）腹泻患者和食品监测中分离的副溶血性弧菌株，进行血清分型，并采用聚合酶链反应（PCR）检测 tdh和trh基因。结果显示，854株副溶血性弧菌中，88．1％为血清可分型，89．8％为产毒株。O3∶K6、O4∶K8、O1∶K25、O4∶K68、O4∶K9、O1∶K36、O3∶K29为上海地区可分型人源株的优势血清型（93．8％），其中O3∶K6最多，达56．2％。副溶血性弧菌全部分离株的月份分布显示出聚集趋势，7～8月为高峰期。O4∶K9和O1∶K36血清型菌株的月份分布与其他优势血清型菌株不同，未表现出明显聚集趋势。食源株无明显优势血清型，且与人源株分布不同。人源株产毒株构成（95．6％）高于食源株（5．5％）。人源株优势血清型产毒株构成（99．9％）高于非优势血清型（71．1％）。血清可分型人源株的 tdh携带率（97．5％）高于不可分型人源株（67．6％），血清可分型人源株的 trh携带率（0．8％）低于不可分型人源株（42．6％）。结果提示，副溶血性弧菌血清型分布与历史数据相比变化较大，血清型与毒力基因携带呈一定程度关联，且人源株与食源株在血清型和毒力基因携带上具有分离现象。因此，在副溶血性弧菌的监测与检测中应充分考虑血清分型和毒力基因的重要性。
- 陈洪友盛跃颖屠丽红宋元君张曦陈敏
- 关键词：副溶血性弧菌血清型TDHTRH
