国家自然科学基金(30700570)
- 作品数:7 被引量:14H指数:3
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- 家鸭×番鸭杂种上调表达基因PCMTD1的克隆
- 2014年
- 为了研究动物杂种优势的分子遗传机制,研究以北京鸭、法国番鸭及其正反交F1代杂种为材料,采用mRNA差异显示(DDRT-PCR)方法分析不同试验组鸭肌肉组织蛋白L异天冬氨酸(D-天冬氨酸)O-甲基转移酶1(PCMTD1)基因的表达差异,结合抑制性消减杂交(SSH)方法加以验证。结果表明:PCMTD1基因在杂种中表达上调;与鸭PCMTD1基因3'-UTR 795 bp片段进行比对,与鸡(Gallus gallus)PCMTD1同源性为85%,期望值(E值)为0。说明杂种优势相关基因克隆成功。
- 单雪松陈洋杨雨江陈辉
- 关键词:杂种优势MRNA差异显示家鸭番鸭
- 家鸭×番鸭杂种下调表达新基因r-MHD2的克隆
- 2009年
- 以北京鸭、法国番鸭及其正反交F1代杂种为试验材料,采用mRNA差异显示(DDRT-PCR)方法分析不同试验组肌肉组织基因表达差异,结合抑制性消减杂交(SSH)加以验证,发现一个杂种下调表达基因r-MHD2,对鸭r-MHD2基因698 bp片段BLASTING结果表明,该基因与鸡(Gallus gallus)、非洲爪蟾Xenopus laevis和Xenopus tropicalis同源性分别为91%、78%和77%。r-MHD2基因的具体分子功能尚属未知。
- 单雪松陈洋崔庆媛李克鹏
- 关键词:杂种优势MRNA差异显示番鸭
- 北京鸭/番鸭杂交体系肝脏组织基因表达差异的研究被引量:3
- 2009年
- 以番鸭、北京鸭及其杂交后代半番鸭为研究对象,利用mRNA差异显示技术得到肝脏组织基因表达差异图谱。mRNA差异显示表明,肝脏组织的基因表达在纯种群和杂种群之间存在着显著的质和量的差异;5对引物组合显示出41条差异带;分属于7类10种基因表达模式,其中量的差异有3类4种,质的差异有4类6种。这些基因差异表达模式说明了杂种的基因表达调控方式发生了变化,可能是mRNA水平上杂种优势形成的分子遗传基础。
- 王金玲单雪松杨雨江王雪丽
- 关键词:肝脏MRNA差异显示杂种优势
- 北京鸭×番鸭杂种优势差异表达基因GHR的克隆
- 2010年
- 以北京鸭、法国番鸭及其正反杂交1代为试验材料,采用mRNA差异显示(DDRT-PCR)方法分析不同试验组肌肉组织基因表达差异,结合抑制性消减杂交(SSH)加以验证,发现生长激素受体(GHR)基因在杂种中上调表达。鸭GHR基因3′端578bp片段测序及比对结果表明,该基因与鸡GHR基因核苷酸序列同源性为90%,氨基酸序列同源性为93%。
- 单雪松陈洋崔庆媛李克鹏杨雨江
- 关键词:杂种优势MRNA差异显示GHR基因
- 东北地区五个引进鸭品种的遗传多样性分析被引量:1
- 2009年
- 通过线粒体D-loop区测序对东北地区的五个引进鸭品种(樱桃谷鸭、长岛鸭、北北京鸭、康贝尔鸭、白冠鸭)20个个体进行了遗传结构的分析,通过对mtDNAD-loop部分序列进行扩增,对PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了710bp的核苷酸序列。通过Mega软件对所得的序列进行比较,共检测出86个位点碱基存在变异,其中包括16个简约信息位点;利用Mega的“Pairwise distance”计算个体间的相对遗传距离。结果表明:其序列差异在0.000~0.082之间,得出20个个体有18种单倍型;并构建了系统发育树。运用DNASP软件计算所得该群体核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样度(Hd)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.01911、0.9842和13.3588。研究结果表明:鸭种群线粒体D-loop区序列个体变异程度很小,但种群的遗传多样性水平很高,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析。
- 刘晶于浩鲍永华牛伟萍张金玉赵志辉张明军
- 关键词:线粒体D-LOOP
- 基于樱桃谷鸭细胞色素b基因的系统发育研究被引量:3
- 2009年
- 采用PCR技术对13个从国外引进的樱桃谷鸭的Cytb基因进行了克隆,测序结果基于Kimura 2-parameter模型进行遗传距离的计算,平均遗传距离0.004,通过DnaSP共检测出18个位点碱基存在变异,其中包括3个简约信息位点;可构成两种主要的单倍型,选取8个鸭品种并用构建了部分鸭科动物的系统发育树,发现樱桃谷鸭与棕颈鸭、太平洋黑鸭、麻斑鸭、野生黄嘴鸭归为一类,具有较高的亲缘性,利用简约信息位点可将8个鸭品种分为三个单倍型,因此研究的结论可以用于鸭科动物的遗传标记筛选和群体的遗传多样性分析。
- 牛伟萍于浩杨春刘晶赵志辉张明军
- 关键词:樱桃谷鸭细胞色素B系统发育
- 北京鸭×番鸭杂种优势相关基因表达差异研究被引量:10
- 2010年
- 用抑制性消减杂交(SSH)方法研究动物杂种相关基因表达差异。选用北京鸭、法国番鸭及其正反交F_1代,以杂种组为处理,亲本组为对照,建立肌肉组织SSH基因文库,随机选取1 000个单克隆测序,并与GenBank序列进行比对分析。结果共发现40个新ESTs,93个未知功能蛋白基因,34个已知功能蛋白基因。在34个已知功能蛋白基因中,杂种表达上调的基因有23个,杂种表达下调的有11个。研究表明杂种优势分子遗传基础复杂,涉及能量代谢、信号传导及调控、转录调控、蛋白质合成加工等基因的差异表达。
- 单雪松崔庆媛李克鹏王雪丽杨雨江
- 关键词:杂种优势抑制性消减杂交北京鸭番鸭