国家教育部博士点基金(20104423120002)
- 作品数:2 被引量:11H指数:2
- 相关作者:刘本荣胡朝晖李爱群刘世明刘本荣更多>>
- 相关机构:广州金域医学检验中心广州中医药大学广州医学院第二附属医院更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金广州市科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 心血管疾病相关基因MEF2单核苷酸多态性在不同人种间的遗传分化度分析被引量:5
- 2010年
- 目的分析肌细胞增强因子2(MEF2)在不同人种间的进化过程,从而揭示其在人类进化及疾病发生过程中的角色和地位,并为MEF2在心血管疾病发生机制方面的研究提供新的视角和切入点。方法利用人类单倍型计划项目发布的单核苷酸多态性频率数据进行生物信息学分析,计算中国汉族人群、欧洲高加索人群、尼日利亚人群和日本东京人群两两之间的遗传分化度,并进行进化发育分析。结果尼日利亚人群MEF2A基因区域与其它3个人群的MEF2A基因区域存在许多高遗传分化度的单核苷酸多态性,部分单核苷酸多态性的遗传分化度值>0.5;而在中国汉族人群、欧洲高加索人群和日本东京人群之间不存在高遗传分化度值的单核苷酸多态性(遗传分化度<0.2)。对于MEF2基因家族的另外三个成员MEF2B、MEF2C和MEF2D的分析结果显示,在以上4个不同人群中,只有MEF2D基因区域存在少数高遗传分化度值的单核苷酸多态性。以上结果提示MEF2A基因在人类走出非洲,向世界各地的迁徙过程中受到很强的自然选择压力,MEF2A基因在人类对环境的适应过程中必然扮演着极其重要的角色。结论 MEF2A基因在人类分化过程中受到很强的歧化选择,MEF2A基因中的单核苷酸多态性在不同人群中的频率差异可能是在对环境的适应过程中逐渐累积的。
- 刘本荣田朝伟钟赟李爱群熊龙根刘世明
- 关键词:心血管疾病
- miR-29下调AKT信号通路中多个基因的表达被引量:6
- 2012年
- 目的 AKT信号通路在心力衰竭的病理机制中扮演重要角色,本研究旨在筛选调节AKT信号通路的microRNA,为进一步研究microRNA在心力衰竭发生发展中的作用奠定基础。方法首先用Gene-SetEnrichmentAnalysis方法及Targetscan和RNAhybrid软件寻找可能调节AKT信号通路的microRNA,然后用双荧光素酶报告系统验证microRNA对AKT信号通路基因3'-UTR的调节作用。结果 GeneSetEnrich-mentAnalysis分析提示:miR-15/16、miR-21、miR-29、miR-103、miR-126、miR-128、miR-129、miR-200和miR-493共9个microRNA家族可能调节AKT信号通路;利用Targetscan和RNAhybrid软件反向验证以上9个候选microRNAs,miR-29与AKT信号通路中的10个基因(TGFβ3、HDGF、VEGF、LEP、PDGFRB、PIK3RI、AKT1、AKT2、AKT3和HIF1A)的3'-UTR杂交分值较高,进一步实验验证发现TGFβ3、VEGF、LEP、AKT1、AKT2、AKT3和HIF1A都是miR-29的靶基因。结论 AKT信号通路中的多个基因都是miR-29的靶基因,可受到miR-29的负调节作用。
- 熊玉娟胡朝晖邱峰刘本荣
- 关键词:心力衰竭AKT信号通路MIR-29