国家质检总局科技计划项目(2009IK276)
- 作品数：2 被引量：19H指数：2
- 相关作者：王婧韩舜愈李敏朱艳盛文军更多>>
- 相关机构：甘肃农业大学国家质检总局兰州大学更多>>
- 发文基金：国家质检总局科技计划项目甘肃省科技厅中小企业创新基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- Nested-PCR检测种传番茄细菌性溃疡病菌被引量：5
- 2011年
- 利用番茄溃疡病菌特异性引物对纯菌液、模拟带菌种子及自然感染种子提取液分别进行Direct-PCR和Nested-PCR检测。结果在纯菌液中,Direct-PCR的检测灵敏度为105cfu/mL,Nested-PCR为102cfu/mL;在模拟带菌种子提取液中,Direct-PCR的检测灵敏度为107cfu/mL,Nested-PCR为104cfu/mL;在自然感染种子提取液中,稀释104倍后Nested-PCR仍然可以检出。建立的番茄种子Nested-PCR检测技术,无需经过核酸提取步骤,可以在8 h内完成整个检测过程,方便快捷,成本低廉,可作为番茄种子带菌的常规检测方法。
- 闵现华刘箐韩跃武文朝慧王军平刘姝彤刘雅莉宋蕤施颖波
- 关键词：番茄溃疡病番茄种子NESTED-PCR
- 巢式PCR快速检测西瓜细菌性果斑病菌被引量：14
- 2014年
- 【目的】建立nested-PCR方法,快速检测西瓜种子中的燕麦嗜酸菌西瓜亚种(Acidovorax avenae subsp.citrulli,Aac),为西瓜细菌性果斑病(bacterial fruit blotch of watermelon,WFB)的防控提供技术支持。【方法】根据Aac BOX短重复序列的PCR产物设计两对引物BX-L1/BX-R5和BX-L1/BX-S-R2,建立以BX-L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR,以5μL样品处理液于99℃高温裂解10 min,再放置冰上冷却5 min,以所释放病原DNA为模板进行PCR扩增,采用50μL反应体系:5μL 10×PCR buffer(25 mmol·L-1MgCl2),4μL dNTP(D4030RA,2.5 mmol·L-1),引物(5μmol·L-1)各3μL,0.4μL Taq DNA酶(DR001B,5 U·μL-1),通过退火温度优化,反应条件为:引物BX-L1/BX-R5各3μL进行第一轮扩增,95℃,2 min;95℃,30 s;65℃,45s;72℃,1 min;35个循环;72℃,延伸7 min;取扩增后的产物1μL为模板,以引物BX-L1/BX-S-R2各3μL进行第二轮扩增,95℃,2 min;95℃,30 s,66℃,45 s,72℃,1 min,30个循环,72℃,7 min。在此条件下对梯度Aac菌悬液、模拟带菌种子提取液进行特异性、灵敏性及重复性检验,对不同带菌率的西瓜种子提取液进行检测。【结果】引物BX-L1/BX-R5和BX-L1/BX-S-R2在检测不同来源的Aac菌株时都产生了预期大小的片段,并且对其近源种燕麦嗜酸菌卡特莱兰亚种(A.avenae subsp.cattleyae)、魔芋假单胞菌(A.avenae subsp.konjaci)及其不相关菌株未扩增出目标片段。以BX-L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR,对Aac纯菌液和模拟带菌种子提取液的最低检测限4.7×101cfu/mL,比direct-PCR灵敏度高出1 000倍。当西瓜种子带菌率在0.1%—0.5%时,nested-PCR阳性检测率为66.7%;当种子带菌率为1%—10%时,nested-PCR的阳性检测率为83%—100%。【结论】以BX-L1/BX-R5为外侧引物,BX-L1/BX-S-R2为内侧引物的nested-PCR方法,能够快速、高效检测携带微量Aac的西瓜种子,检测结果重现性高。
- 王婧毕阳朱艳韩舜愈祝霞盛文军李敏
- 关键词：西瓜细菌性果斑病西瓜种子PCR
