国家自然科学基金(30772401)
- 作品数：3 被引量：12H指数：2
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- 相关机构：中南大学湖南师范大学南华大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 一个新的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体的克隆及鉴定
- 2011年
- 目的:克隆并鉴定NPCEDRG基因mRNA剪接变异体。方法:利用5'-RACE、3'-RACE在CNE2细胞中对NPCEDRG基因mRNA剪接变异体进行扩增,T/A克隆入pMD20载体,所获得的阳性重组子经测序证实。结果:成功克隆得到一种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码一种由98个氨基酸组成的蛋白质,其分子量为10.4 kD,等电点为7.1。结论:利用5'-RACE、3'-RACE等技术成功克隆得到一种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体,为阐述NPCEDRG基因在鼻咽癌发生发展中的可能作用提供线索。
- 侯德富关勇军万恂恂谭宇婷欧阳咏梅余艳辉陈主初
- 鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析被引量：2
- 2011年
- NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3'-TTGCAG-3')的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.
- 侯德富关勇军关瑞万恂恂李国庆欧阳咏梅余艳辉陈主初
- 关键词：RT-PCR
- 人NPCEDRG基因启动子的克隆及CCAAT/NFY结合位点初步分析被引量：12
- 2011年
- NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的一个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.为揭示NPCEDRG基因在鼻咽癌细胞和组织中表达下调的分子机制,联合应用生物信息学和报告基因载体系统分析方法对NPCEDRG基因启动子区进行克隆及功能分析,系统发育进化足迹分析结果表明,NPCEDRG基因5′端调控区-180～+235 bp区间在脊椎动物中高度保守,该保守区域中存在包括CCAAT/NFY、STAT1和SP1等转录因子结合位点.构建Luc和/或EGFP报告基因表达载体并检测其启动子活性,-146～-8 bp区域有较强的启动子活性,电泳迁移阻滞分析实验(EMSA)提示,CCAAT/NFY转录因子结合位点是NPCEDRG基因的转录调控元件.因此,研究确定-146～-8 bp区域是NPCEDRG基因核心启动子区域且启动子核心元件CCAAT/NFY可能参与NPCEDRG基因的转录调控.
- 侯德富关勇军关瑞欧阳咏梅余艳辉陈主初
- 关键词：核心启动子转录调控
