国家自然科学基金(60703016)
- 作品数：4 被引量：23H指数：2
- 相关作者：冯爱民陈松灿刘学军金圣华杨明更多>>
- 相关机构：南京航空航天大学淮阴工学院南京师范大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金江苏省博士后科研资助计划项目国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 增强型单类支持向量机被引量：12
- 2008年
- 现有基于超平面的单类分类器,包括one-class SVM(OCSVM)和马氏one-class SVM(MOCSVM),由于未考虑数据的结构信息或粒度较粗,寻找的超平面很可能是次优解.为此,增强型单类支持向量机(enhanced OCSVM,EnOCSVM)通过在现有SVM算法中加入数据先验信息以克服其不足.首先,EnOCSVM通过聚类得到数据的内在分布簇,而后将各簇结构信息嵌入到OCSVM框架中,最大化间隔的同时,优化输出空间中各簇数据的紧性.由于保留了SVM框架不变,EnOCSVM仍具备原算法的全部优点,并因结合了数据的簇结构信息而具有更好的推广性.标准数据集上的实验表明,EnOCSVM的推广性能较OCSVM和MOCSVM均有显著提高.
- 冯爱民薛晖刘学军陈松灿杨明
- 关键词：单类分类器超平面结构信息支持向量机
- 基于核的单类分类器研究被引量：9
- 2008年
- 以统计学习理论为背景,以核方法为基础的两类典型单类分类算法:单类支持向量机(OCSVM)和支持向量数据域描述(SVDD),均以降低VC维为目标,其中前者通过寻找一个远离原点的超平面,使目标数据所在的正半空间尽量最小;而后者通过寻找一个包含大部分目标数据的最小超球,实现体积最小化.围绕上述两算法,已有大量改进形式出现.本文以此为主线,分别从模型构建、模型改进和数据预处理的角度,进行了回顾和阐述,并对各算法的特点给出了相应的总结.
- 冯爱民陈松灿
- 关键词：核方法单类分类器单类支持向量机
- 基于核苷酸序列的探针水平数据分析
- 2012年
- 微阵列实验是一个复杂的多步骤的实验过程,不确定性存在于实验的每一个步骤中,导致最后得到的实验结果中包含了一些数据噪声。为了从这些含有噪声的数据中得到更多有意义的生物信息,很多算法相继被提出来计算基因表达值。目前流行的mmgMOS模型提高了芯片数据分析的准确性,但是该模型的主要缺点是其参数值φ在整个数据集上是唯一不变的,单一的值不能代表不同探针的真实信号。本文对mmgMOS模型中的参数值φ进行改进,从而进一步提高后续寻找差异基因的准确率。
- 金圣华刘金岭
- 关键词：生物信息学基因芯片基因表达水平
- Affymetrix基因芯片原始数据噪声分析与应用
- 基于杂交原理的生物芯片技术由于实验中非特异性杂交的存在,导致实验数据包含较高的噪音。本文针对目前广泛使用的AffymetrixGeneChip基因芯片,通过对原始数据进行分析研究,得到探针中间三个核苷酸序列和MM/PM探...
- 金圣华刘学军张礼
- 关键词：生物信息学基因芯片基因表达水平
- 文献传递
- 高斯过程回归在翼型气动性能快速评估中的应用
- 翼型设计过程中需要反复评估翼型气动性能,传统的风洞试验和计算流体力学（CFD）评估方法成本高、速度慢。本文在翼型气动性能评估中引入高斯过程回归模型,以辅助传统评估方法。选取一组NACA系列翼型,计算出每个翼型的升力系数和...
- 单志辉刘学军吕宏强
- 关键词：翼型设计
- 文献传递
- Affymetrix基因芯片原始数据噪声分析与应用被引量：2
- 2011年
- 基于杂交原理的生物芯片技术由于实验中非特异性杂交的存在,导致实验数据包含较高的噪声。针对目前广泛使用的Affymetrix GeneChip基因芯片,通过对原始数据进行分析研究,得到探针中间3个核苷酸序列和MM探针与PM探针灰度比值的对应关系;将该对应关系嵌入到基因表达水平的计算中,以改进原有的一个先进的计算基因表达水平的概率模型mmgMOS。通过在标准的spike-in数据集和一个真实的老鼠胚胎数据集上的测试,证明改进的模型有效地提高了基因表达水平计算的精度,同时显著地提高了计算效率,在一定程度上降低了非特异性杂交引起的噪声影响。
- 金圣华刘学军张礼
- 关键词：生物信息学基因芯片基因表达水平
