国家自然科学基金(60571047)
- 作品数：3 被引量：14H指数：3
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- 分块PCA提取细胞周期调控基因的研究被引量：3
- 2008年
- 用主成分分析(PCA)方法处理基因表达微阵列数据能够实现基因选择、基因表达模式提取、基因分类等,有其独特的优点。然而,PCA方法却存在容易丢失重要信息的弱点。为了克服这一方法的弱点,提出分块PCA,并以此为基础形成一种提取细胞周期调控基因的新方法。通过理论分析和对酵母微阵列数据的仿真实验研究,表明这种方法可行、有效,能够全面地提取出隐含在方差较小变量中的细胞周期调控基因,并能够给予实验结果较好的生物意义解释,在微阵列数据处理中具有应用前景。
- 饶妮妮匡斌王成雄任正隆陈曦
- 关键词：分块PCA微阵列数据细胞周期调控基因
- 用主成分分析探索基因表达模式被引量：4
- 2007年
- 以时间点(阵列)为变量,对酵母时间表达序列进行主成分分析,提取出三个主成分:第一主成分代表整个酵母细胞周期中平稳的基因表达状态,第二主成分代表酵母细胞周期中lateG1期和M期差异的基因表达状态,第三主成分表示的是earlyG1期和S/G2期差异的基因表达状态。由第二、和第三主成分揭示出基因表达谱中四个周期性基因表达模式:分别对应lateG1期、M期、earlyG1期和S/G2期,而且发现了一批表达水平呈周期性变化的基因,为进一步研究基因周期性表达和基因调控网络提供有价值的指导。
- 王成雄饶妮妮王玉
- 关键词：主成分分析微阵列基因表达谱基因表达模式
- 基于小波变换技术预测DNA序列的编码区被引量：7
- 2007年
- 三周期性是大多数基因组序列的编码区具有的主要特征.本文提出利用小波变换分析DNA序列编码区的三周期性,形成一种新的基于小波变换的DNA序列编码区预测方法,理论和实验研究证实了新方法的可行性,探测率和正确率分别达到81%和75%,特别是探测率较目前常用的其它一些方法有较大改善.
- 王玉饶妮妮匡斌袁祚涌
- 关键词：DNA序列编码区小波变换
