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国家重点基础研究发展计划(2011CB504902)

作品数:9 被引量:72H指数:5
相关作者:檀晓娟许文波祝双利郑鹏冀天娇更多>>
相关机构:中国疾病预防控制中心海南省疾病预防控制中心北京市疾病预防控制中心更多>>
发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
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文献类型

  • 9篇中文期刊文章

领域

  • 9篇医药卫生

主题

  • 9篇病毒
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  • 8篇肠道病毒
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机构

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  • 1篇解放军医学院

作者

  • 7篇檀晓娟
  • 6篇许文波
  • 4篇祝双利
  • 3篇郑鹏
  • 3篇冀天娇
  • 2篇马焱
  • 2篇陈海云
  • 2篇崔爱利
  • 2篇张宝敏
  • 2篇曾祥洁
  • 2篇李静
  • 2篇黄芳
  • 2篇张勇
  • 1篇胡燕
  • 1篇严冬梅
  • 1篇李瑞生
  • 1篇王全意
  • 1篇陈江婷
  • 1篇高允生
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传媒

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  • 1篇Biomed...

年份

  • 1篇2016
  • 1篇2015
  • 2篇2014
  • 3篇2013
  • 1篇2012
  • 1篇2010
9 条 记 录,以下是 1-9
排序方式:
疫苗接种人群和安慰剂人群肠道病毒A71型基因特征分析被引量:1
2016年
目的 分析比较健康人群接种肠道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)灭活疫苗和安慰剂后EV-A71感染的基因特征。方法 按照1∶1配对的病例对照研究,统计比较接种组和安慰剂组人群中EV-A71导致相关疾病流行病学差异;利用Sequencher 5.0和MEG5.0等生物信息学软件分析不同组别的EV-A71的VP1区核苷酸和氨基酸差异,获得不同人群中EV-A71的分子流行病学特征。结果 本研究共有接种组病例13例(0.3%),安慰剂组106例(2.1%);EV-A71相关疾病发生呈现夏季和冬季两个高峰,主高峰集中在夏季(4~7月),次高峰集中在冬季(11~12月),以安慰剂组人群为主。所有EV-A71毒株与中国2007年以来其他省代表毒株相同,属于C4a亚型;各序列同源性较高,其核苷酸同源性为95.16%~100%,氨基酸同源性为96.94%~100%,与周边省市近3年序列亲缘关系较相近。结论 本研究安慰剂组人群中EV-A71除夏季流行外,在冬季仍有少量EV-A71的循环传播;EV-A71仍为C4a亚型且同源性较高,与周边省市的C4a亚型序列存在共同进化关系。
冀天娇胡雅灵祝双利檀晓娟张宝敏郑鹏王二强孔凡胜陈江婷宋俐霏许文波
关键词:安慰剂基因型
青海省2013年手足口病病原特征和人肠道病毒A组71型基因特征被引量:4
2015年
目的对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_(A71))的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法进行筛查,对HEV_(A71)阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_(A71)各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_(A71)进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%-100.0%和99.0%-100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_(A71)代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_(A71)分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_(4a)进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_(A71)在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%-97.5%和99.0%-99.7%。结论2013年,C_(4a)亚型HEV_(A71)在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。
杨倩赵生仓檀晓娟张勇祝双利冀天娇范丽霞杨维雄刘桂香安洪秋许文波
关键词:手足口病
陕西省2009~2012年肠道病毒71型VP_1编码区基因特征分析被引量:2
2014年
目的对陕西省2009~2012年肠道病毒71型(Enterovirus Type 71,EV71)的分子流行病学特征进行研究。方法采用体外逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction,RT—PCR),对陕西省2009—2012年分离白手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)病例的38株EV71进行衣壳蛋白(Capsid Protein)VP1编码区基因序列扩增。通过双脱氧末端终止法(Sanger法)测序,获得VP1编码区核苷酸序列。采用软件Sequeneher5.0和MEGA5.0对序列进行生物信息学分析。结果陕西省2009~2012年流行的EV71与C4基因型C4a分支具有最高的核苻酸序列同源性,为93.4%~99.4%;与C4a分支代表株在亲缘性关系树上具有最近的进化关系。陕西省EV71具有较高核苷酸和氨基酸序列同源性,分别为93.3%~100%(平均97.3%)和98.3%~100%(平均99.4%)。但相同年代和不同年代EV71毒株间的核苷酸序列平均差异随年代逐渐增大。结论陕西省2009~2012年流行的EV71均属于C4基因亚型C4a分支,为中国近年来流行的优势基因亚型。陕西省EV71具有较高的基因同源性,但基因多态性随着时间逐渐增大。进一步阐明EV71在陕西省的变异变迁规律,需继续开展并加强EV71的分子流行病学监测。
檀晓娟关路媛徐艺冀天娇张宝敏王敬军余鹏博许文波
关键词:肠道病毒71型分子流行病学
2008-2010年C4a人肠道病毒71型在中国大陆的广泛传播和流行被引量:5
2012年
目的了解2008-2010年流行于中国大陆的人肠道病毒71型(humanenterovirus71,HEV71)病毒和2008年安徽阜阳株的进化关系以及C4a进化分支病毒在中国大陆各省、区的传播和流行情况。方法从GenBank上获得2008-2010年中国大陆各省份流行的具有完整VPl(≥891bp)或近似完整VPl(≥876bp)基因的核苷酸序列信息的HEV71毒株序列,采用MEGA5.0软件,构建种系发生树,分析2008-2010年流行于中国大陆各省、区的C4aHEV71病毒与安徽阜阳株间的分子流行病学关系。结果中国大陆2008-2010年流行的HEV71分离株除了8株属于A型,一株属于进化分支C4b外,其他均为C4a;目前流行于中国大陆各省、区的C4a病毒与2008年安徽阜阳株同源性较高(96.5%~100%),其溯源可至1998年的C4b病毒。2008年的阜阳株所引发的传播链主要集中在广东、江苏、上海、湖南、山东等省市。结论中国大陆2008-2010年流行的HEV71分离株以C4a进化分支病毒为绝对优势病毒,阜阳株传播链主要分布在中国南部和以安徽为中心的中原地区。
石晶张燕周剑惠朱贞毛乃颖许松涛崔爱利檀晓娟祝双利张勇严冬梅孔晓慧许文波
关键词:肠道病毒属种系发生疾病传播
肠道病毒71型(EV71)AH3株感染性克隆的构建与鉴定
2014年
目的 构建肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71) AH3株的全基因序列感染性克隆.方法 通过分段扩增和酶切连接将EV71全基因组cDNA片段逐步克隆入PWSK29载体,构建含全病毒基因组序列的重组质粒.转染Vero细胞后,获得拯救病毒.经RT-PCR、酶切、测序、间接免疫荧光(IFA)等方法进行鉴定.结果 酶切鉴定结果与预期一致,序列分析显示为EV71基因;其转染Vero细胞后,可观察到典型的细胞病变;所获得的拯救子代病毒滴度(TCID50)为107.5;IFA检测可见感染细胞出现绿色荧光.结论 成功构建EV71全基因序列感染性克隆,为病毒致病机理及减毒疫苗的研究奠定基础.
侯俊李瑞生胡燕罗声栋白冰珂沈宏辉王志杰柴燕涛杨瑞创貌盼勇
关键词:肠道病毒属
2010年海南省手足口病流行病学和病原学特征分析被引量:8
2013年
为了探究2010年海南省手足口病(Hand-foot-and-mouth disease,HFMD)的流行病学及病原学特征,本研究对2010年海南省HFMD病例报告信息进行整理分析,并对2010年海南省18县市1346份HFMD病例临床标本进行肠道病毒(enterovirus,EV)实验室检测。核酸检测阳性标本进行EV分离和鉴定,对分离到的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)的VP1编码区全长基因进行扩增及序列测定,用Sequencher 5.0和MEGA 5.0等生物信息学软件基于VP1编码区进行EV71的分子流行病学分析。流行病学分析表明:全省18个县市均有病例报告,尤其以东北部县市高发,同时以4岁以下的婴儿为高发人群;而与全国大多省份流行规律不同的是其发病高峰期为9和10月份。实验室结果显示:EV71和CA16是引起2010年海南省HFMD流行的主要病原,但EV71感染在重症病例和死亡病例中占绝对优势。除此之外,还存在部分由其它EV感染引起的HFMD病例。分子流行病学分析提示:2010年海南省流行的EV71均属于C4a亚型,该亚型为我国近年来流行的优势基因型,同时进化分析提示至少存在3条传播链。本研究数据对阐明海南HFMD的流行传播规律,以进一步指导HFMD防控具有重要理论价值。
郑鹏曾祥洁檀晓娟李静马焱陈海云崔爱利祝双利高允生许文波
关键词:手足口病肠道病毒71型流行病学病原学
Molecular Epidemiology of Enteroviruses Associated with Hand, Foot, and Mouth Disease in the Mainland of China被引量:21
2013年
Hand,foot,and mouth disease (HFMD) is a common contagious illness which occurs worldwide both sporadically and in epidemics.The disease mainly affects children and the typical symptoms,which may resolve spontaneously,include mucocutaneous papulovesicular lesions on the hands,feet,mouth,and buttocks.In rare cases,however,the patients may also develop neurological complications such as neurogenic pulmonary edema,aseptic meningitis,and acute flaccid paralysis[1].The most common etiological agents of HFMD are human enterovirus 71 (EV-A71) and
ZHANG YongXU Wen Bo
关键词:分子流行病学肠道病毒肺水肿
海南省2010~2011年手足口病例病原学监测结果分析被引量:8
2013年
目的分析引起海南省2010-2011年手足口病(Hand-Foot-Mouth Disease,HFMD)暴发流行的主要病原及其变化趋势,为海南省手足口病病例诊断和制定防控措施提供病原学依据。方法依据卫生部发布的《手足口病预防控制指南》进行手足口病例样本的处理和实验室检测。采用实时荧光-聚合酶链式反应(Real-time PCR)进行肠道病毒通用引物、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)的核酸检测,核酸检测阳性的原始样本接种人横纹肌肉瘤细胞(Human Rhabdomyosarcoma,RD细胞)进行肠道病毒分离培养,选取有代表性的毒株进行病毒基因序列分析。结果 2010年和2011年海南省手足口重症病例中EV71感染率分别为45.52%和19.45%,而CoxA16的感染率仅为6.9%和4.7%;普通病例中的CoxA16感染率分别达到19.63%和24.8%,EV71的感染率分别为16.34%和6.36%。海南省2010年和2011年流行的EV71基因型均为C4a亚型,CoxA16病毒的基因型包括B1a和B1b,CoxA10、CoxA6和CoxA4也扮演着重要的角色,同时存在CoxA5、CoxB1、CoxB2、ECHO 3和ECHO 11等感染病例。引起海南省手足口重症病例的病原以EV71为主,也有少数病例为CoxA16的感染引起,2010年和2011年重症病例中CoxA16的感染率分别为6.9%和4.7%;而且CoxA10和CoxA6感染引起的重症病例比例较之CoxA4感染引起的重症病例的比例更高。结论海南省2010~2011年手足口重症病例仍以EV71感染为主,普通病例中EV71感染率逐渐下降,CoxA16感染率上升。在海南省人群中同时存在多种肠道病毒病原,导致海南省手足口病疫情的高发和重症病例的持续出现,尤其是CoxA10和CoxA6感染易导致重症病例的发生,值得进一步开展相关研究工作。
马焱陈海云李丹丹檀晓娟曾祥洁郑鹏李静甘晓婷潘正帆黄芳
关键词:手足口病肠道病毒71型柯萨奇病毒A16型
北京市2009年手足口病的病原构成及柯萨奇A组16型病毒基因特征分析被引量:24
2010年
阐明北京市2009年手足口病(Hand-Foot-and-Mouth Disease,HFMD)的主要病原构成并对柯萨奇病毒组16型(Coxsackievirus A16,CoxA16)进行基因特征分析。用逆转录聚合酶链反应(Reverse transcriptase polymerase chain reaction,RT-PCR)方法,对2009年从北京市儿童医院、北京佑安医院、北京地坛医院就诊的975例病例中采集的1044份临床标本进行肠道病毒核酸检测;采用人横纹肌肉瘤(Human rhabdom yosarcoma,RD)细胞对肠道病毒核酸检测阳性的200份咽拭子标本进行病毒分离培养鉴定,并对9株CoxA16分离株进行VP1区编码区序列测定和分析。结果表明2009年北京市HFMD的主要病原为CoxA16(49.4%)和EV71(36.4%),其中CoxA16为优势血清型;此外,还有其它型别的肠道病毒(CoxA4、CoxA10和CoxA9等)共流行。基因分型表明2009年北京流行的CoxA16属于B1a和B1b基因型。
曲梅李洁贾蕾檀晓娟高志勇严寒秋郭婧李锡太黎新宇王全意许文波黄芳
关键词:手足口病基因型
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