上海市自然科学基金(06ZR14021)
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 相关作者：任宁董琼珠武金才孙海晶史炯更多>>
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- 肿瘤转移抑制基因HTPAP的Haploview单体型构建分析被引量：1
- 2008年
- 目的通过单核苷酸多态性（SNP）检测对肿瘤转移抑制基因HTPAP进行单体型构建和分析。方法取100例肝细胞癌（HCC）新鲜标本，应用激光捕获组织显微切割获取纯肝癌细胞、提取DNA，对HTPAP基因上已登录的15个SNP位点进行检测，应用Haploview软件构建单体型。结果15个SNP位点中，有8个表现为单态、5个呈多态性、2个未能检测出。对100例肝细胞癌的该5个多态位点进行单体型构建后发现11种单体型，其中3种单体型（C-A-T-C-A、C-G-T-C-A和T-A-G-G-G）最常见，占87％，另外8种单体型占13％。4个SNP（rs7007097、rs3830326、rs1149、rs3739252）表现为强连锁不平衡关系，尽管rs11539529出现重组现象，但从整体看还是属于同一个单体型块。结论肿瘤转移抑制基因HTPAP在肝癌中常见C-A-T-C-A、C-G-T-C-A和T-A-G-G-G三种单体型，针对不同单体型研究分析可能为肝癌转移复发、预后预测提供新的途径和指标。
- 武金才任宁李国才孙冰生刘道永史炯戴春董琼珠孙海晶叶青海钦伦秀
- 关键词：肝细胞单核苷酸多态性基因
- 肿瘤抑制基因HTPAP单体型构建及其与肝癌转移潜能的关系
- 2013年
- 目的探讨肝细胞癌(HCC)患者肿瘤组织DNA的HTPAP基因单体型与肝癌转移潜能的关系。方法提取864例HCC手术样本DNA,应用焦磷酸测序行SNPs检测,并予单体型构建,分析其与肝癌转移潜能的关系。构建HTPAP启动子单体型pGL3质粒,并分别转染MHCC-97H、HepG2肝癌细胞和正常的肝Hela细胞,分析不同HTPAP启动子单体型对基因转录活性的影响。结果共发现6个SNPs位点[-1053A/G、+64G/C、+357C/G、+1648-/TAAG(无插入和插入TAAG等位基因分别以T/G示,后同)、+1838A/G、+3528C/T]。单体型构建发现HTPAP中共存在11个单体型,其中AGCTAC、GCGGGT、AGCTGC、GCGGAT四种单体型占94.75%。临床病理特征分析提示单体型GCGGGT与高转移潜能正相关(P=0.0003)。启动子序列中两个SNPs(-1053AG和+64GC)存在完全LD,故只有三种启动子单体型(-1053AA/+64GG、-1053AG/+64GC GC和-1053GG/+64CC);双荧光报告法发现三种单体型的HTPAP启动子都具有显著转录活性,其中-1053AA/+64GG单体型启动子转录活性较-1053GG/+64CC和-1053AG/+64GC单体型启动子强,差异具有统计意义(P=0.005,0.009)。结论肿瘤转移抑制基因HTPAP的GCGGGT单体型与HCC高转移潜能正相关。HTPAP启动子单体型对基因的转录活性有显著影响并与术后复发密切相关,提示HCC中HTPAP的不同SNP单体型可能是潜在侵袭转移和复发预后的预测指标。
- 武金才陈虒董琼珠贾户亮任宁
- 关键词：肝细胞单核苷酸多态性单体型
