广西壮族自治区自然科学基金(1044006)
- 作品数：3 被引量：7H指数：2
- 相关作者：胡晓霞张蔚刘斐莫祥兰曾康康更多>>
- 相关机构：广西壮族自治区人民医院武汉大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- miR-31在宫颈癌组织中表达及预测靶基因的生物信息学分析被引量：2
- 2014年
- 目的探讨miR-31在宫颈癌组织中的表达,并对其进行靶基因功能预测等生物信息学分析,为miR-31在宫颈癌发病机制中作用的研究提供理论和实验基础。方法应用实时荧光定量PCR技术检测宫颈癌组织及正常宫颈组织中miR-31相对表达量;通过mirecord网站对miR-31进行靶基因预测,并利用DAVID对靶基因进行GO(gene ontology)功能富集分析及KEGG信号转导通路富集分析。结果宫颈癌组织中miR-31表达(△Ct=4.53±1.64)水平高于正常宫颈组织(△Ct=7.46±1.38);miR-31预测靶基因集合功能富集于生物学调控、蛋白代谢、细胞过程,有机体的发育等生物学过程,以及蛋白结合、底物特异性的跨膜转运活动等分子功能上;KEGG通路分析涉及癌症通路、黏着连接、内吞作用、黑色素瘤、长时程增强、轴突导向等。结论 miR-31在宫颈癌组织中呈高表达,miR-31预测靶基因集合显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中。
- 张蔚郑文静胡晓霞
- 关键词：宫颈癌靶基因生物信息学
- miR-9在宫颈癌组织中的表达及其靶基因的预测和生物信息学分析被引量：3
- 2014年
- 目的探讨宫颈癌组织中miR-9表达,并对靶基因进行预测及生物信息学分析,为深入研究miR-9的调控机制及生物学功能提供理论依据。方法应用miRNAs芯片检测宫颈癌组织及正常宫颈组织中miRNAs表达,利用生物学软件对其中上调较明显的miR-9进行靶基因预测,同时利用基因芯片技术筛选转染miR-9后宫颈癌Hela细胞中差异表达的基因,将两者预测靶基因的交集作为miR-9的靶基因进行GO富集分析和生物通路富集分析。结果与正常宫颈组织比较,宫颈癌组织中有15个miRNAs表达为上调,10个miRNAs表达为下调,其中上调较明显的是miR-21和miR-9,下调较明显的是miR-376a和miR-218。芯片所示的miR-9调控的下调基因与软件预测的靶基因交集中共有148个基因,miR-9的预测靶基因富集在细胞内的生物学调控、合成和代谢等生物学过程以及转录调控和蛋白结合等分子功能上,其信号通路富集于调节肌动蛋白细胞骨架、脂质代谢和细胞黏附通路。结论 miR-9在宫颈癌组织中高表达,miR-9预测的靶基因富集于多个生物学功能和生物学过程及与肿瘤相关的信号通路。
- 张蔚曾康康莫祥兰刘斐胡晓霞
- 关键词：宫颈癌MIR-9靶基因生物信息学
- MiR-9对宫颈癌细胞增殖、迁移及其下游基因表达的影响被引量：2
- 2014年
- 目的探讨miR-9对宫颈癌细胞生物学功能及其下游基因表达的影响。方法将miRNA mimic转染至宫颈癌Hela细胞中,通过MTT法检测细胞增殖情况,Transwell实验检测细胞迁移能力的改变,利用基因芯片检测转染后mRNA的表达,并采用逆转录实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)对芯片检测下调最明显的两个基因进行验证。结果转染miR-9组的细胞增殖倍数明显高于转染NC(Negative Control)组和空白对照组(P<0.05);转染miR-9的迁移细胞数明显高于转染NC组和空白对照组(P<0.05);基因芯片结果显示转染miR-9mimc后共173个基因表达降低,其中降低最明显的两个基因是FSTL1和CDH1。经RT-PCR验证,转染miR-9mimic组FSTL1和CDH1相对表达量明显低于转染NC组(P<0.05)。结论 miRNA-9促进宫颈癌细胞的增殖和迁移,并调节其下游基因的表达。
- 曾康康张蔚胡晓霞莫祥兰刘斐兰娇
- 关键词：MIR-9宫颈癌增殖迁移MRNA
