青岛市科技发展计划项目(10-3-3-17-nsh)
- 作品数：2 被引量：53H指数：2
- 相关作者：王玉丁兆堂杨路成时慧潘璐璐更多>>
- 相关机构：青岛农业大学更多>>
- 发文基金：山东省科技发展计划项目青岛市科技发展计划项目山东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 茶树抗寒调控转录因子ICE1密码子偏性分析被引量：44
- 2012年
- 运用CHIPS、CUSP和CodonW软件程序分析自主克隆的茶树(Camellia sinensis)ICE1(GenBank登录号JX029153)的密码子的偏性,并与茶树基因组及萝卜等7种植物的ICE1密码子偏性进行比较。结果表明,茶树ICE1偏好于以A/T结尾的密码子;与茶树基因组密码子偏性相比,发现只有6种氨基酸密码子偏性完全一致。进一步研究发现ICE1的碱基组成在单子叶植株大麦与7种双子叶植物分化后发生了较大的变化。在聚类分析中,基于基因CDS序列的聚类不能正确反映物种间的进化关系,而基于密码子偏性参数相对密码子使用度(RSCU)的聚类更适合作为系统发育分析的参考。与3种外源受体密码子使用频率比较发现,与大肠杆菌基因组密码子使用频率差值较大的有25个,与酵母基因组差值较大的有15个,与拟南芥基因组差值较大的有10个,这预示着ICE1在拟南芥中的表达效率最高,若要在其他外源受体中进行高效表达,尚需对其密码子进行优化。
- 时慧王玉杨路成丁兆堂
- 关键词：茶树密码子用法密码子偏性抗寒
- 14个‘黄山种’茶树单株的DNA指纹图谱构建被引量：9
- 2012年
- 本研究以筛选出的12条ISSR引物对14个茶树单株进行PCR扩增。结果表明,共扩增出清晰、重复性好的谱带151个,其中,特异带140条,多态性比例为92.72%;应用引物IR43、IR51组合获得了每份茶树单株的特征谱带,可以有效区分出所有供试材料,建立了14份茶树单株的ISSR指纹图谱;经聚类分析,在相似性系数为0.507处,所有材料被分为4个群体。
- 潘璐璐丁兆堂段伦才王玉
- 关键词：ISSR指纹图谱
