国家重点基础研究发展计划(2001CB5120)
- 作品数：6 被引量：46H指数：3
- 相关作者：谢锦云梁宋平张丽军刘昌盛穆宇更多>>
- 相关机构：湖南师范大学中国科学院上海生命科学研究院湘雅医院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金湖南省科技厅重点项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 金鱼雌核发育单倍体发育过程中的比较蛋白质组学研究被引量：3
- 2008年
- 前期已有工作发现在金鱼雌核发育单倍体中一些与发育调控相关的重要蛋白质表达受阻导致单倍体的发育畸形。为了进一步阐明单倍体的发育机制,共收集了3个不同发育时期金鱼单倍体胚胎(HE-1、HE-2、HE-3)进行雌核发育单倍体的差异蛋白质组研究。研究采用二维凝胶电泳进行分离,利用PDQuest软件进行图谱分析,质谱分析初步鉴定到了15个差异蛋白质。这些蛋白质在金鱼雌核发育单倍体的发育中起着重要作用,为进一步阐明单倍体的发育机制奠定了良好的基础。
- 张玲周新文谢锦云黄树林
- 关键词：金鱼胚胎发育过程双向电泳蛋白质组
- 斑马鱼在生命科学研究中的应用被引量：31
- 2007年
- 利用模式生物进行研究是推动生命科学发展的主要手段之一。斑马鱼已成为继小鼠之后的又一个重要的模式脊椎动物。本文将重点介绍斑马鱼在学习记忆和疾病研究领域中的应用,以及我国推动斑马鱼相关研究的策略。
- 刘昌盛穆宇杜久林
- 关键词：斑马鱼学习记忆疾病
- 大腹园蛛(Araneus ventricosus)粗毒双向电泳及质谱分析被引量：3
- 2004年
- 以大腹园蛛粗毒为材料,用固相pH梯度等电聚焦IPG(immobilizedpHgradient,)和SDS-PAGE(sodiumdodecylsulfatepolyacrylamidegelelectrophoresis)获得蛋白质组双向电泳图谱,经Bio-Rad公司的PDQUEST软件进行图像分析,检测到500个左右的蛋白质点.对其图谱的部分蛋白质点酶解后使用Micromass公司的ES-I-Q-TOF进行了鉴定.得到了质量较好的MS/MS数据,然后将其在MS-Fit中的genepeptide数据库和Mascot的Swissprot中进行搜索从而对蛋白质点进行鉴定.目前初步获得5个组分的鉴定结果.
- 柳亦松谢锦云梁宋平
- 关键词：大腹园蛛SDS-PAGE双向电泳
- 采用血清蛋白质组学方法筛选能诱发自身抗体的鼻咽癌相关抗原被引量：4
- 2009年
- 目的采用血清蛋白质组学方法筛选能诱发机体产生自身抗体的鼻咽癌（NPC）相关抗原，以便为NPC诊断和治疗提供候选标志。方法收集19份NPC组织，采用二维凝胶电泳（2-DE）技术分离组织总蛋白质，每份组织样本同时做3块2-DE胶，其中将1块2-DE胶作为制备胶进行考马斯亮蓝染色，另2块2-DE胶采用半干式电转法将胶中的蛋白转至PVDF膜上，并分别与NPC患者自身的血清和健康人血清进行2-DE免疫印迹分析，识别能与多数NPC患者血清反应而不与或很少与健康人血清反应的蛋白质点，再从制备2-DE胶中切取相应蛋白质点，进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MOLDI—TOFMS）和电喷雾电离四级杆飞行时间质谱（ESI-Q—TOFMS／MS）分析，获取肽质量指纹图和肽序列标签，数据库搜索鉴定蛋白质。结果鉴定了13个能诱发机体产生自身抗体的NPC相关抗原：热休克蛋白70（HSP70）、人血清白蛋白（HAS）、热休克蛋白60（HSP60）、细胞角蛋白15（CK15）、亮氨酸氨基肽酶（LAP3）、α-烯醇化酶（Ot—enolase）、ErbB3结合蛋白（EBP1）、细胞角蛋白19（CK19）、核糖体蛋白P0（RPP0）、丙酮酸脱氢酶E1（PDE1）、GTP结合调节蛋白（GNBP）、抗增殖蛋白（prohibitin）和RhoGDP解离抑制因子2（Rho—GDI2），13种蛋白质点在21％的鼻咽癌患者中可见，而健康人中缺乏或出现频率较低。结论本研究筛选到13个NPC相关抗原，这些抗原能诱导患者产生自身抗体，这些抗体有可能成为NPC诊断标志和治疗靶标。
- 易斌陈颖李萃张鹏飞李茂玉易红彭芳陈主初肖志强
- 关键词：鼻咽肿瘤蛋白质组学抗原肿瘤自身抗体肿瘤标记
- 小鼠肝质膜蛋白质的生物信息学研究被引量：2
- 2005年
- 随着高通量蛋白质组研究技术的发展,使用生物信息学方法对鉴定出的蛋白质进行批量的物理化学性质和功能属性的研究显得越来越重要.对2-DE分离的小鼠肝质膜中鉴定的209个蛋白质运用生物信息学方法进行了一系列的功能属性分析,包括统计分析ProtParam软件计算出的209个蛋白质的理论相对分子质量、等电点以及疏水值的分布情况,使用TMHMM预测蛋白质的跨膜区数目,运用系统发生谱方法预测蛋白质相互作用网络,根据其相互作用网络预测部分未知蛋白质的功能.
- 刘珍张丽军谢锦云梁宋平
- 关键词：生物信息学物理化学性质蛋白质相互作用
- 癌症差异蛋白质组学研究中样品分离和鉴定分析技术被引量：3
- 2007年
- 随着人类基因组测序的完成,癌症研究的重点从基因组学转移到蛋白质组学研究中。癌症研究中的差异蛋白质组学技术也飞速发展,包括癌症样品制备、分离,蛋白质鉴定分析、蛋白质组定量研究和翻译后修饰研究等。这些技术极大地推动了与癌症相关的差异蛋白质组学研究,使蛋白质组学在癌症早期诊断、治疗,监测以及发现新药物治疗靶标方面发挥更大的作用。本文主要综述了近年来癌症差异蛋白质组学研究中样品分离和鉴定分析技术。
- 李选文陈平张丽军梁宋平
- 关键词：癌症差异蛋白质组二维电泳色谱
