广东省重大科技项目(2005A20401003)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 相关作者：廖明任涛胡思科席瑞珍更多>>
- 相关机构：华南农业大学河南理工大学更多>>
- 发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”广东省重大科技项目广东省科技计划工业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 4株新城疫病毒F蛋白和HN蛋白的计算机模建与表面抗原分析被引量：4
- 2013年
- 选取新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)广东分离毒GM株(强毒株)和JM株(弱毒株)以及疫苗毒La-Sota株和标准强毒F48E9株,对其融合蛋白(F)和神经氨酸酶(HN)的编码基因序列进行分析,并利用Insight II软件包(Version 2000)进行F蛋白和HN蛋白C端蛋白单体的空间结构模建.结果显示,4个NDV毒株F蛋白单体分子的空间结构极为相似,大致分为3部分,即头部、茎部和柄部.其中头部结构主要由一些折叠股组成,茎部和柄部主要由螺旋结构组成.比较各毒株F蛋白表面蛋白溶剂可及表面积(ASA)后发现,该蛋白有5个线性B细胞表位和8个比较保守的抗原决定簇位点,蛋白头部残基的空间位置随毒株的不同而变异较大.GM株与F48E9株存在36个氨基酸残基的差异,JM株和LaSota株存在20个氨基酸残基的差异.研究结果还表明,4个NDV毒株的HN蛋白C端空间结构较保守,由多个折叠股和4段螺旋结构组成,其抗原决定簇位点也高度保守,只有4个氨基酸残基存在差异.
- 胡思科席瑞珍任涛廖明
- 关键词：F蛋白HN蛋白
