上海市教育委员会创新基金(08ZZ39)
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
- 相关作者：曹广文林丽萍常文军武旗张宏伟更多>>
- 相关机构：第二军医大学邯郸市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：上海市教育委员会创新基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 肾透明细胞癌转移相关的CD99选择性剪接异构体的筛选被引量：3
- 2009年
- 目的:寻找人肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中CD99转移相关选择性剪接异构体,探讨CD99选择性剪接异构体表达与ccRCC转移的关系。方法:通过选择性剪接数据库(alternative splicing database,ASD)对CD99基因可能存在的选择性剪接异构体进行预测。运用自行设计的5对特异性引物,采用RT-PCR技术,在转移组织、发生及未发生转移的癌组织、癌旁组织的各混合样本中检测6种预测异构体的表达,再对电泳所获条带进行克隆、测序。在各个组织样本中检测CD99Ⅰ、CD99Ⅱ和新型CD99选择性剪接异构体(CD99-Ⅲ)的表达。结果:从6种预测异构体中筛选出一种新型异构体(CD99-Ⅲ)。该异构体在转移组织中表达率(8/9)高于未发生转移的原发癌组织(10/21,P<0.05)。CD99Ⅰ型在样本中均表达,CD99Ⅱ型在发生转移的原位癌组织中表达率(6/9)远高于未转移的原发癌组织(3/21,P=0.008)。结论:CD99-Ⅲ为一种新型选择性剪接异构体,且CD99Ⅱ型、CD99-Ⅲ的表达可能与ccRCC的转移进展有关。
- 林丽萍武旗常文军侯建国张宏伟谭晓洁曹广文
- 关键词：CD99肿瘤剪接异构体
- 肿瘤相关蛋白EIF4G1亚型的B细胞表位预测被引量：1
- 2010年
- 目的预测肿瘤相关蛋白EIF4G1亚型的B细胞表位。方法下载EIF4G1蛋白各种亚型的氨基酸序列,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合ABCpred和二级结构预测筛选等方法综合筛选EIF4G1蛋白质亚型特异性的B细胞表位。结果目前已知EIF4G1蛋白的亚型有5种,亚型间的氨基酸变化局限在一个由300个氨基酸形成的序列区域,亚型特异性的B细胞表位可能位于该区域的14～19、21～27、52～61、106～112、113～139、183～189、201～216和217～224位氨基酸残基区域内或附近。结论 EIF4G1蛋白质亚型间存在特异性B细胞表位,这些表位对应用合成肽抗原检测蛋白质亚型和进行肿瘤患者的早期诊断具有重要指导意义。
- 曹廷虎常文军胡锦新朱军曹广文
- 关键词：蛋白质亚型肿瘤
- 肾透明细胞癌组织中转录因子19基因选择性剪接异构体的类型和表达特点被引量：1
- 2010年
- 目的探讨人肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是否存在与细胞生长调节相关的转录因子19(TCF19)选择性剪接异构体,探索其表达特点及其与ccRCC发生的关系。方法通过选择性剪接数据库(alternative Spli-cing Database,ASD)对TCF19基因可能存在的选择性剪接异构体种类进行预测。设计可能存在的5种异构体引物,采用RT-PCR技术,在32例原发肾透明细胞癌的混合样本及癌旁组织的混合样本中分别检测预测异构体的表达,并对电泳所获条带进行克隆、测序。应用RT-PCR定量检测在各个组织样本中异构体TCF19-1、TCF19-3在原发肾癌及癌旁组织的表达差异。结果 ccRCC组织中存在2种新型TCF19替换剪接异构体(TCF19-1、TCF19-3)。RT-PCR检测结果发现这2种异构体在癌和癌旁组织中均表达,但TCF19-1在原发癌组织中表达率高于癌旁组织(P<0.001);TCF19-3在癌旁组织中的表达率与原发癌组织比较,差异无统计学意义(P=0.082)。结论首次发现ccRCC组织中存在2种TCF19选择性剪接异构体TCF19-1和TCF19-3,其中TCF19-1的表达可能与ccRCC有关。
- 钱涛林丽萍常文军曹廷虎徐兴兴杨印辉张宏伟侯建国曹广文
- 关键词：肾肿瘤选择性剪接异构体
- 细胞黏附分子CD99与肿瘤关系的研究进展被引量：3
- 2009年
- CD99分子是细胞黏附分子的一种,参与细胞黏附、凋亡过程及肿瘤细胞的迁移、浸润、侵袭,在肿瘤的发生发展过程中起重要的作用。与正常组织相比,某些肿瘤中CD99出现异常表达,这对于肿瘤的鉴别诊断、转移潜能判断、治疗和预后估计等方面有潜在的应用价值。
- 林丽萍武旗曹广文
- 关键词：CD99肿瘤基因
