北京市科委科技计划项目(D08050603770804)
- 作品数:1 被引量:8H指数:1
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- 相关机构:北京植物园中国林业科学研究院更多>>
- 发文基金:国家林业局科技发展中心项目北京市科委科技计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较被引量:8
- 2013年
- 以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树。通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性。分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726~1.000。共表型相关系数rc介于0.85~0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现。系统树之间的CIc指数范围为0.468~1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异。7个遗传相似系数的S统计值介于16.24%~29.90%,RusselandRao系数最低,SimpleMatching等3个系数S值均大于20%。综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是SimpleMatching系数。
- 黄平崔娇鹏郑勇奇张川红
- 关键词:月季多倍体微卫星标记遗传相似系数聚类分析