江苏省自然科学基金(BK2008334)
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
- 相关作者：黄方何慧喻德跃迟英俊盖钧镒更多>>
- 相关机构：南京农业大学更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金江苏省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 大豆GmTINY1基因的克隆与表达分析被引量：3
- 2009年
- 采用基因芯片技术,从大豆中鉴定了一个荚优势表达基因。利用生物信息学的方法,拼接了该基因的全长序列,并通过RT-PCR克隆了该基因。Blast检索分析表明,该基因编码一个具有AP2结构域的转录因子,且与拟南芥DREB类蛋白TINY的氨基酸相似度最高,将该基因命名为GmTINY1。GmTINY1包含一个735bp的开放阅读框,编码244个氨基酸残基。GmTINY1与拟南芥TINY和TINY2蛋白的相似度分别为59%与62%。系统发生分析表明,GmTINY1、TINY和TINY2位于一个分支,且同属于DREB亚家族。实时定量RT-PCR检测表明,GmTINY1基因在荚中高丰度表达,在花中的表达量也较高,在根中的表达量较低,而在叶片中未检测到表达。基因芯片信息分析结果表明,GmTINY1在种子发育的子叶期的种脐部分高丰度表达。由此推论,GmTINY1基因在大豆生殖器官发育中可能发挥调控作用,可能与种子发育过程中种脐的形成有关。
- 黄方何慧迟英俊盖钧镒喻德跃
- 关键词：大豆转录因子TINYDREB
- 大豆醛脱氢酶基因GmALDH3-1的克隆及在生殖器官中的表达被引量：4
- 2010年
- 为了研究大豆生殖器官发育的分子机制,前期工作中我们利用基因芯片技术进行了大豆花发育相关基因的鉴定,其中一个花优势表达基因在大豆花中的表达量为叶片中的85倍。通过生物信息学方法,拼接了该基因的全长序列,并通过RT-PCR克隆了该基因。BLAST检索分析表明该基因编码醛脱氢酶,命名为GmALDH3-1。GmALDH3-1包含一个1485bp的开放阅读框,编码494个氨基酸残基。GmADLH3-1与白杨醛脱氢酶PtALDH3相似性最高(氨基酸相似率83%,一致率为68%),而与来自于人的HsALDH3B的氨基酸一致率和相似率分别为39%和59%。系统发生分析表明,GmALDH3-1与其他植物ALDH3亚家族成员位于一个分支,且与白杨PtALDH3和拟南芥AtALDH3F1亲缘关系最近。采用实时定量RT-PCR检测了GmALDH3-1基因在大豆叶、根和花中的表达,表明GmALDH3-1基因在花中高丰度表达,在根和叶中未检测到表达。运用基因芯片信息分析了GmALDH3-1在种子发育过程中的表达情况,表明GmALDH3-1在种子发育过程中的外表皮、内表皮、外胚珠和种脐中表达量较高。
- 黄方迟英俊何慧喻德跃
- 关键词：大豆醛脱氢酶生殖器官基因表达
