国家重点基础研究发展计划(2006CB04207)
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 相关作者：陈国敏曾毅尚诚彰杜鹏张怀渝更多>>
- 相关机构：中国疾病预防控制中心四川农业大学北京工业大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 河南地区HIV-1毒株Gag基因抗原表位变异特征及准种特点研究被引量：2
- 2009年
- 目的探讨中国河南地区人免疫缺陷病毒I型（HIV-1）毒株GAG蛋白抗原表位变异特征，并对其准种特点加以分析。方法套式聚合酶链反应（Nested-PCR）扩增确认HIV阳性样本gagp17-p24基因区段并测序，PCR产物纯化后克隆，挑选克隆株鉴定为阳性后测序，以MEGA（version3．0）等软件进行分析。结果河南HIV毒株为B′亚型；gag基因p17区段抗原表位突变有E62G（55．80％），Y79F（48．90％），T84V（48．90％），144V（44．20％），gag基因p24区段抗原表位未见明显变异。结论HIV—1 B′亚型毒株gag基因p17区段的4个抗原表位，存在较大变异，p24区段较为保守，适合抗原表位疫苗的研制。
- 杜鹏陈国敏李泽琳曾毅
- 关键词：HIV-1抗原表位准种
- HIV-1毒株gag和pol基因区抗原表位及耐药性突变分析被引量：2
- 2012年
- 通过研究HIV-1 gag和pol基因序列变异特征,以了解抗原表位变异特点和耐药性突变情况。采集HIV-1阳性全血样本,使用巢式PCR扩增gag和pol基因部分区段,得到23份样本的PCR序列和相应样本的克隆序列gag基因为449份、pol基因为402份,基因分型为HIV-1B和B′亚型。两种亚型的共享序列在选取的8个CTL抗原表位中,共有4个抗原表位发生了8个突变位点;另外位于p24区的5个抗原表位在PCR序列中没有发生变化,但在它们的克隆序列(9.80%)中发生了少数突变。在pol基因PCR序列和克隆序列中发现蛋白酶抑制剂(Protease inhibitors,PIs)和逆转录酶抑制剂(Reverse transcriptase inhibitors,RTIs)耐药性突变位点分别为18个和24个,其中只在克隆序列中发现的PIs和RTIs耐药性突变位点分别占其总数的94.44%(17/18)和62.50%(15/24)。结果显示本研究样本PCR序列中表现出耐药性的比例较高(17.39%),并在克隆序列中存在少数免疫逃逸和耐药性突变,提示部分样本对现行抗病毒药物产生一定程度的耐药。
- 尚诚彰陈国敏张怀渝曾毅
- 关键词：GAGPOL抗原表位耐药性突变
