贵州省科学技术基金(J[2012]2256)
- 作品数：7 被引量：14H指数：3
- 相关作者：林世锋任学良王仁刚王东茂张拓更多>>
- 相关机构：贵州省烟草科学研究所北京蛋白质组研究中心贵州省烟草科学研究院更多>>
- 发文基金：贵州省科学技术基金中国烟草总公司科技项目贵州省科技厅农业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 烟草蛋白酶抑制剂基因的电子克隆及生物信息学分析被引量：4
- 2012年
- 蛋白酶抑制剂可以增强植物对病虫害的抵抗能力,为了深入研究蛋白酶抑制剂在烟草中的作用机制,利用生物信息学的方法,成功获得了烟草品种K326中的4种蛋白酶抑制剂cDNA序列(NtPI-1、NtPI-2、NtPI-3和NtPI-4)并对其进行了序列分析。它们编码的氨基酸序列都具有典型的马铃薯蛋白酶抑制剂Ⅰ家族功能结构域,属于马铃薯蛋白酶抑制剂Ⅰ家族成员。序列分析表明,4种蛋白酶抑制剂基因cDNA序列均具有完整的开放读码框,依次编码128、95、94和72个氨基酸残基,它们的氨基酸序列一致性在31%-38%之间。系统树分析表明,烟草品种K326中的4种蛋白酶抑制剂分散在进化树的不同位置,形成不同亚群。
- 林世锋王仁刚任学良
- 关键词：烟草蛋白酶抑制剂电子克隆生物信息学
- 烟草半胱氨酸蛋白酶抑制剂(CPI)基因家族的克隆及组织表达谱分析被引量：5
- 2014年
- 运用生物信息学方法,结合RT-PCR和SMART RACE技术从烟草(Nicotiana tabacum)中克隆了4个CPI基因的全长cDNA序列,分别命名为NtCPI1、NtCPI2、NtCPI3和NtCPI4,GenBank登陆号分别为KF057988、KF057989、KF057990和KF057991。基因序列分析表明4个基因分别编码98、98、120和123个氨基酸残基的蛋白质,都具有CPI反应位点的保守基序GG、QXVXQ和A/PW,同时具有植物CPI所特有的LARFAV基序,其中NtCPI3和NtCPI4的N端还包含一段27个氨基酸残基组成的信号肽。实时荧光定量PCR试验表明,4个基因的组织表达谱很广,在根、茎、叶和芽组织中都有表达。研究结果为进一步研究半胱氨酸蛋白酶抑制剂在植物中的生理功能奠定了基础。
- 林世锋元野任学良邹颉黎瑞源郭玉双赵杰宏王仁刚
- 关键词：烟草半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因家族克隆组织表达谱
- 烟草肌醇半乳糖苷合成酶基因NtGolS1的克隆及序列分析被引量：3
- 2012年
- 为从烟草中克隆到与植物抗逆相关的肌醇半乳糖苷合成酶基因GolS,以辣椒GolS基因为探针,通过电子克隆法从烟草栽培品种K326中分离出一条编码GolS基因的cDNA序列,暂被命名为NtGolS1。NtGolS1包含一个完整的开放读码框,编码343个氨基酸,具备糖基转移酶保守结构域;序列比对结果表明,NtGolS1蛋白与其他植物的GolS蛋白具有很高的相似性;系统进化树分析表明,NtGolS1与耐旱植物维柯萨的Gols亲缘关系最近。这些结果为进一步研究NtGolS1的性质和功能,并为植物抗逆基因工程研究提供理论基础。
- 林世锋王仁刚任学良王东茂张拓黄亚娟
- 关键词：烟草克隆
- 两个烟草多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因的克隆和表达分析
- 2015年
- 为了研究多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)在烟草中的生物学功能,运用生物信息学方法,结合RT-PCR和SMART RACE技术,从烟草中克隆到2个多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)基因c DNA和DNA全长序列,分别命名为Nt PGIP1(Gen Bank登录号:KF317203)和Nt PGIP2(Gen Bank登录号:KF317204)。Nt PGIP1基因全长为1 413 bp,编码338个氨基酸;Nt PGIP2基因全长为1 185 bp,编码329个氨基酸;两基因均没有内含子序列,核苷酸序列有50%的一致性,编码的氨基酸序列有54%的一致性。两基因编码蛋白均含有植物PGIP蛋白特有的重复保守序列LXXLXXLXXLXLXXNXLXGXIPXX。对PGIP基因在烟草不同组织表达量分析发现,两基因在根、茎、叶和芽中均有表达,其中均在茎中表达量最高,其次是根,叶中表达量很低。
- 林世锋安雪琴杨承王仁刚任学良赵杰宏付强
- 关键词：烟草多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因克隆
- 烟草LEA3基因的克隆及序列分析
- 2012年
- 为从烟草中克隆到与植物抗逆相关的胚胎晚期丰富蛋白(LEA)基因,以番茄LEA3基因为探针,通过电子克隆的方法从烟草栽培品种K326中克隆到2个第3组LEA基因(NtLEA3-1和NtLEA3-2),并对其进行了序列分析。结果表明:2个LEA3基因的cDNA序列均包含完整的开放读码框,分别编码167和166个氨基酸,具有8个LEA3基元序列。亲水性分析表明NtLEA3-1和NtLEA3-2蛋白富含亲水氨基酸,是一种高度亲水性的蛋白,其蛋白二级结构中均以α-螺旋构象为主。NtLEA3-1和NtLEA3-2的氨基酸序列与番茄的一致性最高为79%,与其他已经发现的LEA3蛋白的一致性在42%～62%之间,表明NtLEA3-1和NtLEA3-2是2个新的烟草LEA3基因。
- 林世锋任学良王轶王东茂张拓王仁刚
- 关键词：烟草克隆
- GASA基因超家族新成员——烟草抗菌肽基因的克隆及序列分析被引量：3
- 2012年
- 抗菌肽可以增强植物对病原微生物的抵抗能力,本研究利用生物信息学方法,获得了烟草品种K326的3种抗菌肽cDNA序列(NtSN1a、NtSN1b和NtSN2a),并对其进行了序列分析。结果表明,3种抗菌肽cDNA序列均具有完整的开放读码框,NtSN1a和NtSN1b均编码88个氨基酸,NtSN2a编码104个氨基酸。对推导的氨基酸序列分析发现,它们都具有典型的GASA基因超家族保守结构域,属于GASA基因超家族成员。系统进化分析表明,NtSN1a和NtSN1b与马铃薯抗菌肽snaking-1聚为一类,NtSN2a与马铃薯抗菌肽snaking-2聚为一类。这些结果为进一步研究抗菌肽基因的抑菌效应,比较其在烟草抗病防御反应中的作用奠定了基础。
- 林世锋任学良王东茂张拓王仁刚
- 关键词：烟草抗菌肽
- 烟草胞质6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因的克隆及表达分析
- 2015年
- 采用电子克隆的方法,结合RT-PCR和SMART RACE技术,首次从烟草(Nicotiana tabacum)中克隆到1个胞质6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PGDH)基因的c DNA序列,命名为Nt6PGDH(Gen Bank登录号:KM211534)。该基因c DNA全长1 932bp,开放阅读框1 455 bp,编码484个氨基酸,与番茄(Solanum lycopersicum)和马铃薯(Solanum tuberosum)的6PGDH氨基酸序列一致性最高,为95%。生物信息学分析表明,Nt6PGDH氨基酸序列不存在信号肽和转运肽,无跨膜结构域,定位于细胞质。对烟草不同发育时期Nt6PGDH基因的表达情况分析发现,Nt6PGDH基因在烟草旺长期根、茎、叶中的表达量均高于苗期,并且在同一发育时期,烟草根中表达量最强,茎次之,叶片最弱。
- 林世锋付强余婧赵杰宏任学良王仁刚
- 关键词：烟草基因克隆
