教育部留学回国人员科研启动基金(J20090028)
- 作品数:2 被引量:16H指数:2
- 相关作者:余小林张海娟吴剑锋胡帅王芳展更多>>
- 相关机构:浙江大学更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 基因芯片分析芜菁雌蕊退化突变体tpa及野生型开放花的转录组差异被引量:4
- 2011年
- 【目的】基于转录组水平分析芜菁雌蕊退化突变(turnip pistil aborted,tpa)发生的可能原因,为揭示芸薹属作物雌蕊发育的分子遗传调控机制提供研究依据。【方法】利用tpa及其野生型植株的开放花制备的mRNA反转录成cDNA与拟南芥ATH1芯片进行杂交,筛选出在tpa及其野生型植株中表达有差异的基因,并利用RT-PCR技术对芯片筛选出的基因进行验证。【结果】获得了152个在野生型(W1)和完全退化株(M3)转录组中差异表达的基因,61个在W1和部分退化株(I2)转录组中差异表达的基因,以及24个在I2和M3转录组中差异表达的基因,上述差异基因分别属于细胞壁合成与调控、防卫与胁迫反应、转录调控、蛋白质代谢以及普通新陈代谢等9个不同的功能类别。通过对41个基因的RT-PCR验证,获得了At2g42840、At1g57750、At5g20630、At2g03090、At3g08030、At5g08000、At2g28790、At5g63310和At2g24270等9个在tpa及野生型植株中具显著不同的时空表达特性的基因。【结论】拟南芥cDNA芯片可用于分析tpa及其野生型基因的转录差异,筛选获得的9个显著差异基因不但在雌蕊发育等生殖发育过程起重要作用,还参与了植物营养生长的生理生化过程。
- 吴剑锋张海娟卢海宇王芳展余小林
- 关键词:芜菁雌蕊发育转录
- 白菜BcRALF基因启动子的分离
- 快速碱化因子(Rapid Alkalinization Factors,RALF)是最早从烟草叶片中发现的一类多肽信号类物质。本研究中在已分离得到白菜BcRALFi基因全长序列的基础上,采用TAIL-PCR技术克隆获得白...
- 阮玉蓉胡帅王芳展刘振宁刘亚培余小林
- 关键词:白菜启动子
- 文献传递
- 芜菁NAC转录因子BcNAC2基因的分离及其表达被引量:12
- 2011年
- 根据拟南芥NAC2的全长序列设计引物,从芜菁中成功分离了NAC转录因子BcNAC2基因,该基因最大开放阅读框为1683bp,编码560个氨基酸,共包含6个外显子和5个内含子。将BcNAC2与其他30个NACs蛋白进行序列比对以及重构系统进化树分析发现,BcNAC2与十字花科的拟南芥的同源性最高,芜菁BcNAC2与拟南芥NAC2蛋白功能结构域内的特征序列有显著的差异。半定量RT-PCR的结果表明,BcNAC2呈部分组成型表达特征,在授粉8d的嫩角果中表达丰度最高,而且组织原位杂交结果显示,BcNAC2在胚囊中有较高的表达,由此推测,BcNAC2与芜菁的种子或胚的发育相关。
- 张海娟吴剑锋胡帅余小林
- 关键词:芜菁NAC转录因子基因分离半定量RT-PCR