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国家重点基础研究发展计划(2005CB523401): 作品数：11 被引量：64H指数：5; 相关作者：乔延江王耘张燕玲史新元张培更多>>; 相关机构：北京中医药大学更多>>; 发文基金：国家重点基础研究发展计划北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>

中药复杂性研究的内容与方法被引量：16: 2005年; 中药的复杂性问题日益受到重视。本文从复杂系统的特征出发,论述了中药复杂性研究的三条主线,探讨了中药复杂性研究的基本内容,按信息学研究的基本内容,将中药复杂性研究分为四类基本问题,并初步探讨了各类问题的基本特征及研究思路与方法。; 王耘史新元乔延江; 关键词：复杂系统信息技术中药

常用活血化瘀类中药组分数据库的构建被引量：8: 2006年; 目前,中药组分数据库多以化学成分的结构、活性为主,但缺少相关中药的药性、功效和药理作用等信息,难以适应中药组分数据挖掘的要求。为了有利于探讨功效与药理之间的关联关系,本文以53味常用活血化瘀类中药及其1646个组分数据为例,采集其基本信息,并按作用机制相同或相似等原则规范功效和药理数据,以ISIS/Base数据库管理系统为平台,建立常用活血化瘀类中药组分数据库。数据库由组分实体、中药实体、文献实体及其关系构成,其中组分实体有组分二、三维结构、来源和活性等13个属性,中药实体有药性、功效和药理等18个属性,文献实体有文献ID和具体文献2个属性,3个实体间的数据表通过控键互相切换。本数据库针对性强,数据相对完备,结构易与其它中药成分或天然产物数据库兼容,适于开展活血化瘀类中药药性、功效、药理指标及其物质基础的数据挖掘研究。本数据库的建立不仅为活血化瘀类中药及其组分的数据挖掘提供了研究平台,而且为探讨中药组分的数据挖掘提供了有效的方法和思路。; 刘颖王耘乔延江; 关键词：活血化瘀数据库中药

基于药效团的药性物质基础研究被引量：12: 2009年; 中药药性的物质基础研究是中药现代化进程中的关键问题之一。本文针对此问题,提出了"物质决定药性,物质基础共同属性与药性之间存在内在相关性"这一假说,并提出了基于药效团的药性物质基础的研究方法和预期研究成果。本文利用中药有效成分族辨识技术,以活血化瘀中药为研究载体,初步探讨了以药效团为代表的物质基础共同属性与中药药性的内在相关性,从而为药性物质基础研究提供了一个新的突破口。; 张燕玲王耘乔延江; 关键词：药性药效团

支持向量机在构建白介素-1β转化酶抑制剂药效团模型中的应用被引量：4: 2009年; 以24个作用于人体外围血单核细胞药理模型的白介素-1β转化酶抑制剂作为研究对象,计算了其表征分子的拓扑、电子、几何结构等物理化学性质的1209个分子描述符,用CfsSubsetEval评价方法和BestFirst-D1-N5搜索方法筛选描述符,用Kennard-Stone方法选择训练集和测试集。分别采用支持向量机、决策树、贝叶斯网络、人工神经网络等机器学习方法建立分类预测模型并使用Catalyst/HipHop系统建立药效团模型。结果表明支持向量机优于其他分类模型,正、负样本的预测正确率均达到100%。最优药效团模型具有5个特征:2个疏水基团、2个脂性氢键受体、1个氢键给体;以此药效团进行中药数据库筛选得到384个候选白介素-1β转化酶抑制剂。利用支持向量机建立的分类预测模型对候选化合物的活性进行了预测,其中高活性化合物占96.6%,表明白介素-1β转化酶抑制剂药效团模型较准确地反映了高活性化合物的公共特征。该模型的建立有助于从中草药筛选新型白介素-1β转化酶抑制剂。; 杨晔张燕玲乔延江; 关键词：支持向量机

氯代芳烃类化合物毒性及三维结构的定量关系研究被引量：5: 2006年; 目的:建立氯代芳烃类化合物毒性的三维定量构效关系模型,探索研究化合物毒性数据和三维结构参数之间关系的新方法。方法:利用比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA),建立了一组具有发光菌毒性的氯代芳烃类共化合物的三维定量构效关系模型。结果:得到了较好的构效关系模型,其交叉验证相关系数q2=0.702,非交叉验证相关系数r2=0.947,标准偏差SE=0.151,F=18.027。结论:该模型具有较好的预测能力,表明降低甲基对位负电性或减弱甲基邻位、间位、对位取代基亲水性可以降低化合物毒性。; 郭亦然张燕玲乔延江; 关键词：氯代芳烃

中药有效成分族辨识信息技术研究被引量：5: 2008年; 中药有效成分族是指作用于同一靶点、具有相同作用机理的中药有效成分之总称。整合信息学、化学、生物学等多学科技术的中药有效成分族辨识信息技术是揭示中药物质基础的方法和技术之一。本文从中药化学成分数据库的构建、中药有效成分族的辨识与验证三个环节探讨了中药有效成分族辨识信息技术的建立及应用。; 张燕玲王耘史新元乔延江; 关键词：药效团

基于中药有效成分族的方剂物质基础研究被引量：4: 2008年; 本文以血管紧张素转化酶(Angiotensin Converting Enzyme,ACE)抑制剂、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-Hydroxy-3-Methylglutaryl Coenzyme A Reductase,HMG-CoAR)抑制剂和血管紧张素Ⅱ(AngiotensinⅡ,AngⅡ)、血小板活化因子(Platelet Activating Factor,PAF)受体拮抗剂三维药效团为辨识模型,以三维数据库柔性搜索技术为辨识算法,发现了18首活血化瘀方剂及其所含20味中药可能具有的ACE、AngⅡ、PAF和HMG-COAR受体活性的物质基础。结果表明,中药有效成分族的研究将为从分子层次上揭示方剂物质基础提供方法学支撑。; 张燕玲王耘艾路乔延江; 关键词：活血化瘀

距离比较法构建HMG-CoA还原酶抑制剂药效团被引量：1: 2008年; 目的:考察不同模板分子对距离比较法(DIStance COmparison,DISCO)构建HMG-CoA还原酶抑制剂药效团模型的影响。方法:以MDDR数据库中作用于大鼠肝细胞的13个HMG-CoA还原酶抑制剂为训练集,将活性最高的6个活性分子逐一作为模板分子,用DISCO方法构建的HMG-CoA还原酶抑制剂三维药效团模型和比较分子力场分析法(Comparative Molecular Field Analysis,CoMFA)进行分析。结果:最优HMG-CoA还原酶抑制剂药效团模型包含两个氢键受体和两个疏水中心,其模板分子的刚性和活性适中。结论:利用DISCO方法构建药效团模型时,合理选择模板分子是保证药效团可靠的关键因素之一。; 崔建华张燕玲乔延江; 关键词：药效团模板分子

2型糖尿病定性模型的建立及应用被引量：1: 2008年; 糖尿病是一类复杂性疾病,针对糖尿病病理机制的系统建模以及在此基础上的血糖控制策略研究一直是糖尿病研究的重要方向之一。本文针对2型糖尿病治疗药物及其作用分子网络,结合2型糖尿病的病理机制,建立一种2型糖尿病定性模型,以期为2型糖尿病关键靶点识别、糖尿病复方药物的优化提供新的思路。; 余立王耘乔延江; 关键词：2型糖尿病系统生物学

贝叶斯网络在中药有效组分五味预测中的应用被引量：14: 2008年; 目的:应用贝叶斯网络学习算法预测中药有效组分的五味。方法:基于现代药理实验数据构建中药五味的贝叶斯网络模型,获取贝叶斯网络拓扑图和条件概率表。结果:所建模型稳定可靠,可用于预测中药或中药有效组分的五味。结论:贝叶斯网络可用于中药或中药组分五味的预测,为中药药性研究提供一种新的研究方法,对组分药性及组分配伍研究具有重要意义。; 张培李江王耘乔延江; 关键词：数据挖掘贝叶斯网络

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