国家高技术研究发展计划(2006AA042184)
- 作品数：2 被引量：9H指数：2
- 相关作者：郭力李伯杨聂峰光李晓霞方晓健更多>>
- 相关机构：中国科学院过程工程研究所中国科学院研究生院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- GPU并行计算集群上的LAMMPS分子动力学模拟性能测试被引量：6
- 2011年
- 近年来GPU作为一种具有极强运算能力的多核处理器,得到了快速的发展,成为高性能计算领域的主要发展方向。各种分子动力学模拟的主流软件也纷纷使用GPU技术,其中LAMMPS较早地开发出了通用的并行GPU版本。本文利用nVIDIA公司最新Femi架构的Tesla C2050 GPU搭建了小型的基于LAMMPS的分子动力学模拟GPU并行计算集群,通过氩原子熔化的算例对集群性能进行了测试,测试的内容包括CPU集群、单节点单GPU、单节点多GPU以及多节点GPU集群。比较了各种情况的加速倍数并对造成性能改变的原因进行了讨论,分析了用于MD模拟的GPU并行计算集群性能的瓶颈所在,提出可能的解决方法,搭建集群时,充分考虑PCI总线的承受能力,对于集群效率的提高有很大好处。测试结果表明,集群的性能较高,相对于以往的单机以及CPU集群,计算的规模大大提高了,加速比也在20倍以上。可以预测,在未来一段时间内,多GPU并行是分子动力学模拟的发展方向。
- 李伯杨聂峰光李晓霞郭力
- 关键词：GPU并行计算
- GPU加速的并行粒子模拟在线可视化被引量：3
- 2011年
- 粒子模拟是研究离散粒子和连续介质运动规律的常用方法。而大规模的粒子模拟通常借助高性能计算系统。近年来,得益于其众核架构,图形处理器(GPU)已成为高性能计算的重要设备,并被广泛用于大规模粒子模拟过程的加速。本文讨论了一种对GPU加速的分布式粒子模拟进行在线可视化的方法。在该方法中,GPU除了被用于加速粒子模拟过程外,也被用于数据到图像的快速转换。同时,并行绘制技术被用于分布式数据的可视化。通过本文所述的方法,用户可在并行计算运行过程中,通过显示于拼接显示墙的高分辨率图像,实时地观察到粒子模拟中发生的现象,并对计算过程进行跟踪和调整。
- 方晓健徐骥戚华彪何险峰葛蔚
- 关键词：GPU科学计算可视化
