内蒙古自治区自然科学基金(200607010101)
- 作品数：14 被引量：31H指数：4
- 相关作者：李前忠左永春杨科利杨磊樊国梁更多>>
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- 突触前和突触后神经毒素的分析和预测
- ＜正＞本文从数据库[1]上下载174条突触前神经毒素和332条突触后神经毒素,根据数据库上面给出的注释信息,首先统计了这两类神经毒素的二硫键分布数目（表1）,结果发
- 杨磊李前忠左永春
- 关键词：神经毒素二硫键
- 文献传递
- 高压静电场对蒙古黄芪愈伤组织增殖和分化的影响被引量：3
- 2007年
- 蒙古黄芪愈伤组织经场强为±1.0 kV/cm的高压静电场处理后生长速率明显提高,超氧化物酶(SOD)活性,过氧化氢酶(CAT)活性和蛋白含量明显高于对照,过氧化物酶(POD)、吲哚乙酸(IAA)氧化酶活性和丙二醛(MDA)含量明显降低.正负高压静电场处理的结果存在着明显差异,正高压静电场能够有效地促进蒙古黄芪愈伤组织芽的分化,而负高压静电场能够有效地促进根的分化.
- 梁运章吴座功柳伟力邢永飞
- 关键词：高压静电场蒙古黄芪愈伤组织
- 基于支持向量机的多类凋亡蛋白亚细胞位置预测被引量：2
- 2008年
- 基于支持向量机,以全部和局部氨基酸序列的n肽组分、序列的亲疏水性分布等五种特征提取方法构成特征向量表示蛋白质序列,对六类细胞凋亡蛋白的亚细胞位置进行预测.结果表明,基于氨基酸二肽组成成分构成的特征向量集(以符号DIPE表示)的预测结果高于其它四种特征向量集的预测结果,在Jackknife检验下,总预测成功率达到了89.3%;与现有的方法比较,发现对于Mitochondrial类凋亡蛋白,支持向量机方法有更好的预测效果.
- 陈颖丽李前忠樊国梁杨科利
- 关键词：支持向量机
- 基于氨基酸组分和支持向量机的动物毒素的预测
- 2009年
- 动物毒素是一种具有非常广泛用途的生物毒素,有必要提出一种能够快速、准确预测动物毒素的理论算法.基于动物毒素蛋白质序列的二肽组分信息,提出了一种离散增量结合支持向量机的ID-SVM的算法,并使用此算法对不同序列相似性的动物毒素进行了预测,取得了较好的结果.为了说明ID-SVM算法在预测生物毒素方面的优越性,在这里将ID-SVM算法应用到Saha和R aghava构建的细菌毒素和非毒素的数据库上,预测结果显示ID-SVM算法的预测结果高于Saha和R aghava所用算法的结果.
- 杨磊李前忠左永春李涛
- 关键词：动物毒素支持向量机
- 基于正则模型预测Cys2His2型锌指蛋白与DNA相互作用
- ＜正＞Cys2His2型锌指蛋白是一类最重要的真核生物转录因子,其主要作用是与DNA结合,指导酶与模板的正确结合,活化RNA聚合酶,以便有效的启动转录机制。因此,
- 李涛李前忠左永春
- 文献传递
- 秋水仙素诱导蒙古黄芪多倍体的研究被引量：4
- 2010年
- 以黄芪种子和带子叶的上胚为处理对象,用在培养基里添加不同浓度秋水仙素的方法,研究了秋水仙素不同浓度、不同处理时间对黄芪多倍体诱导的影响.结果表明,两种处理对象的诱导效果受秋水仙素浓度和处理时间两方面的影响.以成熟种子为处理对象,各种秋水仙素浓度和处理时间组合均可诱导出多倍体植株,但以秋水仙素浓度100mg/L,处理时间14d的组合加倍率最高,达13.3%;以带子叶的上胚为处理对象,从秋水仙素浓度50mg/L,处理时间7d开始有较低的加倍率,以秋水仙素浓度100mg/L处理时间7d的加倍效果最好,为10.9%.细胞染色体鉴定结果为:四倍体染色体数为2n=4x=32;而二倍体的染色体数为2n=2x=16.
- 张利珍李前忠
- 关键词：蒙古黄芪秋水仙素多倍体诱导
- 基于序列信息理论预测线虫基因选择性剪切位点被引量：2
- 2008年
- 基因的选择性剪切使得在DNA上一段相同的序列翻译成多个不同的蛋白质序列.选择性剪切的出现把剪切位点分为选择性供体位点、组成性供体位点、选择性受体位点和组成性受体位点.基于EBI中的线虫基因选择性剪切位点数据库,选取不同位点的单碱基频率和序列片段的三联体频数作为参数,利用位置权重矩阵和离散增量结合支持向量机,对选择性剪切位点进行了理论预测.对选择性供体位点和选择性受体位点的预测成功率分别为63.78%和72.63%,特异性分别为68.02%和83.96%.
- 杨乌日吐李前忠杨科利林昊
- 关键词：选择性剪切受体位点支持向量机
- 基于支持向量机方法预测神经毒素
- 2009年
- 神经毒素是一种应用非常广泛的毒素,因此有必要提出一种能够快速、准确预测神经毒素的算法.这里基于神经毒素蛋白质序列的n肽组分和序列的亲疏水性分布信息,提出了一种离散增量结合支持向量机的ID-SVM的算法,对神经毒素和细胞毒素进行了预测.为了将ID-SVM的预测算法和其它的预测算法进行比较,将ID-SVM算法应用到Saha和R aghava构建的神经毒素和非神经毒素的数据库上.预测结果显示,ID-SVM算法的预测结果高于Saha和R aghava所用的算法的预测结果.
- 杨磊李前忠左永春李涛
- 关键词：神经毒素细胞毒素离散量支持向量机
- 基于正则模型预测Cys_2His_2型锌指蛋白与DNA相互作用
- 2009年
- Cys2His2型锌指蛋白是一类最重要的真核生物转录因子,其主要作用是与DNA结合,指导酶与模板的正确结合,活化RNA聚合酶,以便有效的启动转录机制。因此,
- 李涛李前忠左永春
- 突触前和突触后神经毒素的分析和预测
- 2009年
- 本文从数据库[1]上下载174条突触前神经毒素和332条突触后神经毒素,根据数据库上面给出的注释信息,首先统计了这两类神经毒素的二硫键分布数目(表1),结果发现:突触前神经毒素的蛋白质中含有3条二硫键的蛋白质序列有81条。
- 杨磊李前忠左永春
- 关键词：神经毒素二硫键
