国家自然科学基金(30772069) 作品数:22 被引量:98 H指数:6 相关作者: 郭奕斌 潘敬新 艾阳 蒋玮莹 赵燕 更多>> 相关机构: 中山大学 福建医科大学 四川大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
黏多糖贮积症Ⅵ型表现型和基因型的相关性研究 被引量:3 2017年 目的对3家拟诊为黏多糖贮积症Ⅵ型(MPSⅥ)的患儿及其父母进行芳香基硫酸酯酶B(ARSB)基因的突变检测,以阐明其分子发病机制并揭示MPSⅥ表现型和基因型的相关性。方法尿糖胺聚糖(GAG)定性检测后对患儿及其父母的DNA进行ARSB基因的PCR扩增及Sanger测序。对所发现的新突变,用变性高效液相色谱(DHPLC)法进行快速筛检,用多种生物信息学方法对新突变的致病性进行系列鉴定。结果家系1先证者为c.943C>T和c.1197C>G的复合杂合子;家系2先证者为c.523T>G/p.Y175D(新突变,父源)和c.1197C>G/p.F399L(母源)的复合杂合子;家系3先证者的E2和E3无扩增产物,而其父母均有400 bp和459 bp特异带。DHPLC结果显示,正常对照组和患儿母亲为正常单峰,而患儿及其父为异常双峰。正常和突变的ARSB蛋白的高级结构存在明显差异;突变点所在氨基酸在物种进化过程中具有高度保守性;Poly Phen-2和SIFT软件预测结果:Probably damaging(很可能有害)和Damaging(有害的)。结论家系2的p.Y175D是一新的致病性突变,为患儿发病的内在原因之一。家系1和2可确诊为MPSⅥ型,其表现型和基因型有显著的相关性;家系3虽经酶检确诊,临床症状、尿检结果也均与MPSⅥ型符合,但DNA水平未查到明确突变类型,其表现型与基因型的相关性有待进一步证实。 姜煜 郭源平 艾阳 唐佳 方子水 杜敏联 郭奕斌基因诊断中测序技术的应用及优缺点 被引量:32 2014年 基因突变是当今生命科学研究的热点之一,其检测方法和诊断技术发展迅猛.测序技术在基因病的确诊、分型等方面发挥着不可或缺的作用.文章重点围绕第一~三代测序技术的研究进展、优缺点及其在基因诊断中的应用进行评述,并对未来的发展趋势进行了预测和展望. 郭奕斌关键词:基因病 基因诊断 测序技术 α-甘露糖苷贮积症的分子遗传学及其在临床诊断与防治方面的意义 2013年 MAN2B1基因突变导致α-甘露糖苷酶缺乏或活性降低是引起α-甘露糖苷贮积症的根本内因。对MAN2B1基因、LAMAN酶的结构和功能的研究、基因型与表现型的相关性研究以及诊防治方面的研究近年来都取得了诸多新进展。本文重点围绕这几方面作一综述。 吴晓昀 张杰 郭奕斌关键词:分子遗传学 一罕见成骨不全Ⅳ型的基因诊断 被引量:4 2013年 目的对一疑似成骨不全Ⅳ型或其他类型的患儿实施基因诊断,以揭示患儿发病及频繁骨折的内在原因,为今后实施对症治疗和产前基因诊断创造必要的前提条件。方法对经症状、体征观察和X线检查初诊为成骨不全Ⅳ型或其他类型的患儿,在抽取外周血制备DNA模板后,采用PCR、DNA直接测序法,对患儿的COL1A1基因进行突变检测,然后对所发现的突变进行分析和鉴定。结果在COL1A1基因的编码区内发现一典型的错义突变(c.823G>C1/p.G275R),经查HGMD数据库证实为成骨不全Ⅳ型的致病性突变。结论先证者为一罕见的成骨不全Ⅳ型患儿,所发现的p.G275R突变为中国人群首次报道的病理性突变。 郭奕斌 艾阳 蒋玮莹关键词:基因诊断 黏多糖病的诊断及防治策略 被引量:11 2009年 郭奕斌关键词:黏多糖病 SULFATE 中间代谢产物 遗传性代谢病 硫酸皮肤素 硫酸软骨素 X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良一家系报道 被引量:3 2008年 郭奕斌 王晶晶关键词:X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良 家系报道 基因突变分析 遗传病 A methodology study of preimplantation genetic diagnosis of Morquio IVA syndrome Objective To establish effective and specific methods of preimplantation genetic diagnosis so as to pave the w... Yibin Guo Jingxin Pan Dongwei Guo Yan Zhao Weiying Jiang Xinyuan Liu关键词:PREIMPLANTATION REFRACTORY DIGESTION LINKAGE 中国人黏多糖贮积症ⅣA型家系GALNS基因新突变的鉴定 被引量:5 2011年 目的研究黏多糖贮积症ⅣA型(mucopolysaccharidosis type ⅣA,MPSⅣA)患者发病的分子遗传学机制,揭示其基因型与表现型的相互关系,为产前基因诊断等创造必要的前提条件。方法采用尿糖胺聚糖(glycosaminoglycans,GAGs)定性检测法对疑似MPSIVA型的先证者进行初诊,然后采用PCR及扩增产物直接测序法对先证者及其家庭成员进行突变检测。在检出GALNS基因c.1567T〉G新突变后,先后建立XspI酶切鉴定法和扩增阻碍突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)快速特异鉴定法,对随机采集的110名正常对照与先证者及其家庭成员的GALNS基因第14外显子进行序列分析,同时采用生物信息学方法对蛋白质二级、三级结构进行预测,以及直接测定患儿GALNS酶活性的方法,对该新突变进行致病性鉴定。结果先证者尿检呈弱阳性GAGs(±),其GALNS基因第14外显子内存在杂合的c.1567T〉G终止密码突变,第4外显子存在杂合的c.374C〉T错义突变,为两种突变的复合杂合子。其妹突变类型与先证者完全相同,其母仅在第14外显子存在杂合的终止密码突变,为该病的携带者,其父仅在第4外显子存在杂合的错义突变,也为杂合子;第14外显子的PCR产物经XspI酶切后,正常对照组切出28bp、120bp、399bp3条带,而患者和携带者的母亲均切出28bp、120bp、148bp和399bp4条带;用ARMS特异引物扩增后,正常对照组均扩增阴性,而患者及携带者均扩增阳性;蛋白质二级、三级结构预测结果显示:c .1567T〉G变异导致终止密码(TAG)突变为谷氨酸(GAG),使多肽链延长了92个氨基酸残基,导致蛋白质二、三级结构发生明显改变,而正常对照无此变化。酶活性测定的结果显示:患者的GALNS酶活性仅为8.3nmol/17h/mgpr,明显低于正常值(正常参考值为41.9~92.1nmol/17h,/mgpr)。结论c.1567T� 赵燕 孟亚仙 郭奕斌 杜敏联 艾阳Research advance of preimplantation genetic diagnosis 2011年 Preimplantation genetic diagnosis (PGD), as a new assisted reproductive technology which can select normal embryos for transplantation combined with in-vitro fertilization and embryo transfer(IVF-ET)through the analysis of genetic materials before embryo implantation, holds a more and more important position in the diagnosis of genetic diseases and has made an important significance to the Aristogenics.PGD is an important aspect of assisted reproduction technology(ART)with its rapid development. Continuous appearances and comprehensive applications of new methods and technologies have greatly developed the PGD. In this review, we introduce some new methods and their principles about the new research advances of PGD. AI Yang ZHANG Mengmeng GUO Yibin关键词:基因 分子技术 ARMS结合测序法快速产前诊断广东一例MPSⅡ高危胎儿 目的 用ARMS直接鉴定结合测序法对再次孕育的粘多糖贮积症Ⅱ型(MPSⅡ)高危胎儿进行快速产检,从而及时而高效地防患病胎出生,真正实现优生。方法 首先应用尿粘多糖定性检测法对先证者进行初诊,然后用微量快提法制备DNA模板... 郭奕斌 孟亚仙 潘宏达 杜传书关键词:ARMS法 产前基因诊断