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国家自然科学基金(41206141)

作品数:4 被引量:25H指数:3
相关作者:杜晓东焦钰郑哲王庆恒邓岳文更多>>
相关机构:广东海洋大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学生物学文化科学更多>>

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 2篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇珠母贝
  • 3篇马氏珠母贝
  • 2篇基因
  • 1篇荧光
  • 1篇荧光定量
  • 1篇外套膜
  • 1篇克隆
  • 1篇基因克隆
  • 1篇分子
  • 1篇分子特征
  • 1篇靶向
  • 1篇贝壳
  • 1篇PM
  • 1篇CY
  • 1篇MIR-21...
  • 1篇PB

机构

  • 3篇广东海洋大学

作者

  • 3篇焦钰
  • 3篇杜晓东
  • 2篇邓岳文
  • 2篇王庆恒
  • 2篇田荣荣
  • 2篇郑哲
  • 1篇黄荣莲
  • 1篇闫芳
  • 1篇郝瑞娟
  • 1篇潘晓艳

传媒

  • 1篇中国农学通报
  • 1篇广东海洋大学...
  • 1篇基因组学与应...

年份

  • 1篇2016
  • 2篇2015
4 条 记 录,以下是 1-3
排序方式:
马氏珠母贝磺基转移酶PmCHST9基因的分子特征与表达分析被引量:18
2015年
糖胺聚糖在抗病毒、消炎和抗氧化等免疫反应发挥重要作用。磺基转移酶(sulfotransferase)是糖胺聚糖生物合成的关键酶,Carbohydrate sulfotransferase 9(CHST9)可以将磺酸基从3'-磷酸腺苷酰-5'磷酸硫酸盐(PAPS)转移到半乳糖残基非还原末端的4位碳上。为研究CHST9在马氏珠母贝免疫调节中的作用,本研究克隆得到马氏珠母贝CHST9(Pinctada martensii CHST9,Pm CHST9)c DNA全长序列并检测其在不同组织中的表达模式。利用RACE技术,得出Pm CHST9序列全长1 388 bp,其中5'UTR为122 bp,3'UTR为192 bp,开放阅读框(ORF)为1 074 bp,编码357个氨基酸;Pm CHST9氨基酸序列分子量为42 889.2 Da,等电点为9.28,脂溶性系数为81.32,总平均亲水性为-0.493;氨基酸序列分析得出Pm CHST9具有典型的磺基转移酶-2结构域和一个跨膜结构域;多序列比对结果显示Pm CHST9与其它物种的CHST9同源性较低;荧光定量PCR检测结果表明Pm CHST9在鳃中表达量最高,其次是足和肝胰腺。综上所述,Pm CHST9可能参与马氏珠母贝的免疫调节作用,为进一步阐述Pm CHST9在马氏珠母贝中的免疫机制提供基础资料。
郝瑞娟郑哲王庆恒王庆恒焦钰邓岳文
关键词:马氏珠母贝分子特征
miR-210在马氏珠母贝外套膜矿化机制中的结构和功能预测被引量:3
2016年
为进一步探究Pm-miR-210在马氏珠母贝贝壳形成的作用,利用miR-RACE技术验证Pm-miR-210的成熟体序列并进行序列分析,通过生物信息学分析来获得Pm-miR-210的前体序列,并进行组织定量和靶位点预测。结果表明,Pm-miR-210的miR-RACE结果与高通量测序结果一致,利用转录组数据库与Pm-miR-210成熟体序列比对,获得的前体序列长度为80 bp并具有典型的颈环结构。多序列比对结果显示,Pm-miR-210成熟体序列的种子区域在不同物种间具有极高的保守性。荧光定量结果得出,Pm-miR-210在外套膜边缘膜和中央膜中均有表达,但表达量差异不具统计学意义(P>0.05)。靶向预测分析结果显示,钙调蛋白(calmodulin)、钙调磷酸酶-A亚基(calcineurin A subunit)、N19以及Shematrin-3为Pm-miR-210的候选靶基因。
潘晓艳郑哲田荣荣焦钰杜晓东
关键词:马氏珠母贝
马氏珠母贝CyPB基因的克隆与表达分析被引量:3
2015年
为了探究亲环蛋白B(Cy PB)在马氏珠母贝中的作用机制,运用c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆得到马氏珠母贝Cy PB基因(Pm Cy PB)c DNA的全长序列,并且应用实时荧光定量PCR技术对Pm Cy PB基因在马氏珠母贝不同组织中的表达进行检测。结果显示,Pm Cy PB基因序列全长1266 bp,其中开放阅读框(ORF)为678 bp,编码225个氨基酸,5′-UTR为62 bp,3′-UTR为526 bp。预测其相对分子量为24829.3,理论等电点5.77。多序列比对结果显示Pm Cy PB基因与其他物种的Cy PB具有较高的保守性。SMART软件对Pm Cy PB进行蛋白质序列分析,发现它包含亲环蛋白家族典型的肽脯氨酰顺反异构酶的结构域。实时荧光定量PCR数据分析表明,该Pm Cy PB基因在马氏珠母贝闭壳肌、肝胰腺、血细胞、外套膜、足、性腺、鳃这7种组织中均有表达,在外套膜表达量最高,其次是鳃。结果可为进一步阐述Pm Cy PB在马氏珠母贝中的免疫防御机制提供一定的理论基础。
田荣荣闫芳杜晓东焦钰黄荣莲王庆恒邓岳文
关键词:马氏珠母贝CYPB基因克隆荧光定量
共1页<1>
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