国家自然科学基金(41206158)
- 作品数：2 被引量：9H指数：1
- 相关作者：董纯明邵宗泽刘金禄白秀花张荣秋更多>>
- 相关机构：国家海洋局第三海洋研究所南方医科大学宁波大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海洋公益性行业科研专项国家海洋局青年海洋科学基金更多>>
- 相关领域：生物学天文地球更多>>
- Draft Genome Sequence of Sphingobium sp. C100, a PAH-degrading bacterium from the deep-sea sediment of the Arctic Ocean
- Sphingobium sp. strain C100 was isolated from a polycyclic aromatic hydrocarbon(PAH)-degrading consortium from...
- Chunming DongXiuhua BaiQiliang LaiYanrong XieXin ChenZongze Shao
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- 文献传递
- 海洋石油降解菌深海弯曲菌的种类多样性及地理分布特征分析被引量：1
- 2017年
- 深海弯曲菌(Thalassolituus)是一类海洋专属的石油降解菌.为认识其多样性与地理分布、获取石油降解菌资源,本研究对西太平洋和厦门近海的表层海水分别通过石油烃富集和直接涂布石油烃平板,对获取的菌株进行了分离鉴定.在此基础上,对Gen Bank数据库中该属的可培养和未培养菌株信息,进行了系统进化与物种多样性分析.结果表明,从西太富集菌群分离得到的32个菌株中,主要优势菌为假单孢菌(Pseudomonas)和海杆菌(Marinobacter);其次是食烷菌(Alcanivorax)和弧菌(Vibrio).深海弯曲菌仅有2株,但它们代表1个潜在的新种,它们与模式菌株T.marinus IMCC1826T的同源性仅为96.9%和97.0%.从厦门表层海水中分离到1株深海弯曲菌,与模式菌株T.marinus IMCC1826T的相似度为99.66%.基于本研究分离菌株及Gen Bank可培养及未培养菌株的16S rRNA基因序列开展的系统发育分析表明,该属存在3个明显的进化分支,即2个模式种T.oleivorans与T.marinus分别代表的2个分支和1个独立分支;此外,不同分支呈现明显的地理分布特征,即来自同一纬度范围的菌株或序列多聚类于同一分支中.我们推测,深海弯曲菌在进化过程中,可能因适应不同纬度海域的温度等环境因子,逐步进化出3个不同环境适应性的分支.本研究加深了对深海弯曲菌在不同温度海洋环境中种类多样性分布特征的认识,为海洋石油污染生物修复提供了新资源.
- 刘仁菊董纯明李登峰邵宗泽
- 关键词：海洋生物学石油烃生物降解
- Hyphomonas beringensis sp. nov. and Hyphomonas chukchiensis sp. nov., isolated from surface seawater of the Bering sea and Chukchi Sea
- Two Gram negative, non-spore-forming, oval to pear shaped motile strains, designated 25B14T and BH-BN04-4T, is...
- Chongping LiQiliang LaiGuizhen LiChunming DongJianning WangYueting LiaoZongze Shao
- 关键词：TAXONOMY
- 白令海和楚科齐海表层沉积物中多环芳烃降解微生物多样性
- 为了研究白令海(海盆及陆架)至楚科齐海陆架表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌的多样性,并获得新的PAHs降解菌资源。在GC-MS分析沉积物中PAHs种类和含量的基础上,以萘、菲和芘的混合物为唯一碳源和能源对表层沉积物...
- 张荣秋董纯明盛华芳白秀花矫立萍刘金禄汪卫国周宏伟邵宗泽
- 关键词：表层沉积物多环芳烃生物多样性
- 文献传递
- Hyphomonas beringensis sp. nov. and Hyphomonas chukchiensis sp. nov., isolated from surface seawater of the Bering sea and Chukchi Sea
- Two Gram negative, non-spore-forming, oval to pear shaped motile strains, designated 25B141T and BH-BN04-4T, i...
- Chongping LiQiliang LaiGuizhen LiChunming DongJianning WangYueting LiaoZongze Shao
- 文献传递
- 白令海和楚科奇海表层沉积物中多环芳烃降解微生物多样性被引量：8
- 2014年
- 为了研究白令海（海盆及陆架）至楚科奇海陆架表层沉积物中多环芳烃（PAHs）降解菌的多样性，并获得新的PAHs降解菌资源。在GC—MS分析沉积物中PAHs种类和含量的基础上，以萘、菲和芘的混合物为唯一碳源和能源对表层沉积物样品进行富集，通过平板分离鉴定可培养菌株，并验证其降解能力；同时利用变性梯度凝胶电泳（DGGE）和Illumina高通量测序技术分析降解菌群结构。GC—MS测定结果表明，14个表层沉积物中PAHs总干质量介于32．99～276．97ng／g。富集菌群中共分离获得51株可培养细菌，平板纯培养、PCR—DGGE及Illumina测序结果均表明，菌群中优势的降解菌是7Lproteobacteria的Marinobacter，Pseudoalteromonas，Pseudomonas和Actinobacteria门的Dietzia菌。此外，Illumina测序结果还表明14个降解菌群在菌群结构组成上，可分为海盆区和陆架区两种类群；同时检测到一些低丰度的海洋专属PAHs降解菌，如Cyclo—clasticus，Alteromonas和Neptunomonas等。本文结果将加深对白令海及楚科奇海表层沉积物中PAHS降解菌资源与生物多样性的认识。
- 张荣秋董纯明盛华芳白秀花矫立萍刘金禄汪卫国周宏伟邵宗泽
- 关键词：表层沉积物多环芳烃
- 白令海和楚科齐海表层沉积物中多环芳烃降解微生物多样性
- 为了研究白令海(海盆及陆架)至楚科齐海陆架表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌的多样性,并获得新的PAHs降解菌资源。在GC-MS分析沉积物中PAHs种类和含量的基础上,以萘、菲和芘的混合物为唯一碳源和能源对表层沉积物...
- 张荣秋董纯明盛华芳白秀花矫立萍刘金禄汪卫国周宏伟邵宗泽
- 关键词：表层沉积物多环芳烃生物多样性
