国家自然科学基金(30600329)
- 作品数：5 被引量：12H指数：2
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- 相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- DNA计算机中二叉树的层次遍历算法
- 提出了 DNA 计算机中二叉树数据结构的一种设计方法,给出了具体的存储结构以及层次遍历的算法。该算法实现了在 DNA 计算机下二叉树元素的遍历。依据分子生物学的理论,算法是有效且可行的。
- 杨春德魏国辉任静静杨孝田
- 关键词：二叉树遍历
- 文献传递
- 基于不同算法的Motif预测比较分析与优化被引量：6
- 2009年
- 研究转录因子结合位点(TFBs)的主要预测模型及其预测的算法,通过基于调控元件预测的3种代表性的算法MEME、Gibbs采样和Weeder预测拟南芥基因组。比较结果表明,Gibbs采样算法和Weeder算法预测长、短motif效率较高。重点分析MEME算法,提出结合不同算法查找motif的优化方法,并以实验验证该方法能有效提高预测效率。
- 张斐谭军谢竞博
- 关键词：转录因子结合位点
- 一种基于贪心EM的改进预测算法
- 2011年
- 本文主要研究了Motif预测算法,在贪心EM预测算法基础上进行分析优化,并形成新的预测方法。工作重点是在参数的初始化,对参数模型的重新划分并引入Kd-树的层次聚类的方法,建立新的PKG算法。预测结果表明,在预测较大数据集方面新算法有一定的优势,尤其是对同一物种的序列预测具有更强的搜索和分类能力,在没有影响时间复杂度的前提下显著的提高了搜索的效率。
- 张斐
- 卵磷脂与细胞周期被引量：1
- 2006年
- 卵磷脂作为哺乳动物细胞膜结构组成的重要成分,在细胞增殖过程中表现出周期性的变化.卵磷脂生物合成和分解代谢中关键酶的共同作用调节卵磷脂的变化规律,尤其是CTP:磷酸胆碱胞苷转移酶和非钙依赖的磷脂酶A2在其中起着非常重要的调节作用.在简述卵磷脂在细胞周期中的变化规律的基础上,详细阐述了卵磷脂周期性变化规律的调节机理,并就卵磷脂和细胞周期的关系及其重要生物学意义与相关疾病发生关系进行了探讨.
- 常平安秦文珍魏进民
- 关键词：卵磷脂细胞周期
- 反向重复序列法构建神经病靶标酯酶RNA干涉表达质粒
- 2007年
- 目的构建基于通用真核表达载体的人神经病靶标酯酶双链RNA的稳定表达载体。方法在正义和反义引物两端分别加上EcoRⅠ和BamHⅠ的识别位点扩增得到神经病靶标酯酶活力域序列,构建含有目标基因的倒置重复序列的双链RNA表达载体pcDNA.NTE.dsRNA,酶切分析鉴定重组载体。脂质体法转染到Hela细胞中瞬时表达重组载体,酶活力测定其对细胞内神经病靶标酯酶活力的影响。结果成功构建了NTE双链RNA稳定表达载体pcDNA.NTE.dsRNA,表达该载体细胞内NTE活力明显下降至对照细胞的20%左右。结论采用反向重复序列法将靶标基因的编码序列正反向插入到通用真核细胞表达载体中,是构建哺乳细胞基因双链RNA稳定表达载体的有效方法。
- 常平安伍一军
- 关键词：RNA干涉
- DNA计算机中图的深度优先搜索遍历算法被引量：5
- 2008年
- 提出DNA计算机中图数据结构的一种设计方法,给出具体的存储结构以及深度优先搜索遍历的算法。该算法实现了在DNA计算机下图元素的遍历。为证明其可行性,给出一个具体的算法实例,描述了DNA计算机上的运行机制。依据分子生物学的理论,证明算法是有效且可行的。
- 魏国辉杨春德谭军
- 关键词：DNA计算机深度优先搜索遍历
- Identification of human patatin-like phospholipase 1 and a mutant in HeLa cells
- In recent years,a mammalian family of lipid hydrolases,designated"patatin-like phospholipase (PNPLA)"has attra...
- 常平安
- 关键词：HUMANMUTANTHELA
- 文献传递
- Degradation of mouse NTE-related esterase by macroautophagy and the proteasome
- In recent years,a mammalian family of lipid hydrolases,designated"patatin-like phospholipase (PNPLA)"has attra...
- 常平安
- 关键词：MACROAUTOPHAGYPROTEASOME
- 文献传递
