辽宁省教育厅基金资助项目(2004C019)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
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- 丙氨酸甘氨酸混合三、四肽构象稳定性的快速预测被引量：1
- 2007年
- 使用特殊氢方法预测丙氨酸甘氨酸混合三肽和四肽分子共111个构象的相对稳定性,并与B3LYP/6-31G*方法的相对能量比较,得到了满意的结果.在所有111个构象中,特殊氢方法相对能量与B3LYP/6-31G*方法相对能量偏差绝对值大于2.0 kcal/mol的只有3个,偏差在1.0-2.0 kcal/mol之间的有18个,其余均小于1.0 kcal/mol.本文结果表明特殊氢原子在决定多肽构象稳定性方面的内秉重要性.
- 王长生鹿秋梅
- 合理预测甘氨酸-α-多肽构象稳定性的有效途径被引量：1
- 2005年
- 使用B3LYP/6 31G*方法,优化得到了甘氨酸多肽分子 CH3CO(NHCH2CO)nNHCH3(n=1,2,3)的 18 个稳定构象.对构象中存在的非键作用进行了分析,确定了影响构象稳定性的主要非键作用,并估算了相关非键作用的能量.将之应用于判断二肽、三肽、四肽分子构象的相对稳定性,得到了满意的结果.该方法和 B3LYP/6 31G*方法得到的相对能量的线性相关方程为:y=0.887 3 x+0.647 3, 相关系数为R=0.939 7,最大偏差为 3.5 kJ/mol,标准偏差为1.47 kJ/mol.
- 李晓静王长生
- 关键词：B3LYP构象稳定性相关系二肽甘氨酸CH
- 丙氨酸-α-五肽构象稳定性的快速预测被引量：1
- 2007年
- 定义了丙氨酸-α-多肽中的特殊氢原子,对构象中与特殊氢原子有关的主要非键作用进行分析,提出使用与特殊氢原子有关的主要非键作用预测多肽构象稳定性,并将之称为特殊氢方法.基于丙氨酸-α-二肽和三肽分子共12个构象,我们确定了与特殊氢原子有关的7个非键作用参数.利用特殊氢方法定量预测丙氨酸-α-五肽分子65个低能构象的相对稳定性,与B3LYP/6-31G*方法比较,得到了满意的结果.
- 王长生高飞王潇伟
