湖北省教育厅科学技术研究项目(Q20081204)
- 作品数：3 被引量：12H指数：3
- 相关作者：许巧情董明钢谢骏赵朝阳袁汉文更多>>
- 相关机构：长江大学中国水产科学研究院淡水渔业研究中心中国科学院更多>>
- 发文基金：湖北省教育厅科学技术研究项目湖北省自然科学基金农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 三角帆蚌微卫星富集文库的构建、鉴定及多态性分析被引量：5
- 2010年
- 通过磁珠富集法构建了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)微卫星富集文库。共获得800个阳性克隆,其中的100个阳性克隆经测序分析,共获得微卫星序列54个。利用这些微卫星序列可设计33对引物,经过PCR扩增筛选获得了25对可用引物。利用聚丙烯酰胺凝胶电泳,对洞庭湖1个种群的30只三角帆蚌进行扩增,发现13对引物呈现多态性,等位基因数在4～9。观测杂合度在0.2543～0.9827,期望杂合度在0.3629～0.8217,信息多态含量平均为0.5198。由于存在无效等位基因,两个微卫星基因座(GenBank登录号为GQ302651和GQ302658)明显地偏离哈代-温伯格平衡,但没有发现连锁不平衡现象。这说明利用磁珠富集法构建的三角帆蚌微卫星文库质量较好,13对多态性微卫星引物可为三角帆蚌微卫星连锁图谱构建、分子进化和系统发育研究、分子标记辅助育种以及经济性状的QTL定位提供帮助。
- 许巧情谢骏张书环赵朝阳袁汉文
- 关键词：三角帆蚌PCR扩增多态性
- 不同固定剂及固定时间对三角帆蚌DNA提取效果比较被引量：5
- 2009年
- 以三角帆蚌（Hrriopsis cumingii）为对象，研究了无水乙醇，95％乙醇，4％多聚甲醛，福尔马林溶液，TE缓冲液5种固定剂不同固定时间对三角帆蚌斧足DNA提取质量及PCR扩增的影响。结果显示95％乙醇固定后提取的三角帆蚌基因组DNA降解少，DNA浓度高，OD260／OD：80在1．8～2．0之间，OD260／OD230在1．5左右，表明95％乙醇固定后三角帆蚌基因组DNA的提取质量最好，再依次为无水乙醇、福尔马林溶液、4％多聚甲醛，DNA提取质量最差的是用TE固定的三角帆蚌。
- 许巧情董明钢
- 关键词：基因组DNA固定剂PCR扩增
- 三角帆蚌不同组织基因组DNA提取效果比较被引量：4
- 2010年
- 利用平衡酚-氯仿法分别提取三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)斧足、鳃、闭壳肌、性腺、肝脏、心脏中的基因组DNA,采用紫外分光光度测定法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增法分析三角帆蚌不同组织基因组DNA的提取质量。结果表明,三角帆蚌6个组织均能成功地提取基因组DNA,但提取的DNA质量存在差异;斧足中提取的DNA纯度、浓度最高,PCR扩增的条带最亮,因而是三角帆蚌提取DNA的最佳组织;其次是肝脏和闭壳肌,心脏和性腺提取的DNA较差。
- 许巧情刘俊
- 关键词：三角帆蚌基因组DNA
