大连市科技计划项目(2006E11SF068)
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 相关作者：马飞朱丽娜戴雅丽李庆伟沙诗宇更多>>
- 相关机构：辽宁师范大学安徽农业大学山西生物应用职业技术学院更多>>
- 发文基金：教育部科学技术研究重点项目大连市科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 日本七鳃鳗(Lampetra japonica)肝脏ESTs分析与比较转录组研究被引量：6
- 2007年
- 以日本七鳃鳗(Lampetra japonica)肝脏为材料构建cDNA文库,在文库中随机挑选克隆子进行测序共得到10077条有效ESTs(expressed sequencetags)序列.ESTs序列分析显示,8515条ESTs拼成648条片段重叠群,共得到2210条转录本,其中47.06%的转录本预测为全长序列;利用BLAST程序在GenBank数据库中进行同源性搜索发现2053条转录本有同源序列匹配,占总转录本的92.9%.更进一步对这些基因产物进行GeneOntology注释,结果发现,在日本七鳃鳗肝脏中与有颌类免疫、凝血和代谢相关的基因大量表达,并预测了8个新基因.通过对日本七鳃鳗与底鳉(Fundulus heteroclitus)、鼠(Mus musculus)、牛(Bos taurus)和人(Homo sapiens)肝脏转录组的比较分析,发现日本七鳃鳗肝脏中比其他物种优势表达的是甲壳质酶和多糖代谢等相关的基因,这些基因可能在日本七鳃鳗免疫中发挥重要作用.此外,也利用TargetScan软件对日本七鳃鳗肝脏转录组中3'UTR区进行microRNA靶标识别,结果发现了与人类癌症基因调控同源的microRNA靶标,这为研究人类癌症提供了有益的线索.上述结果将为七鳃鳗功能基因和蛋白组学的研究以及脊椎动物的基因组进化提供重要的理论基础.
- 朱丽娜戴雅丽马飞李庆伟
- 关键词：肝脏EST
- 噬菌体及其宿主终端酶序列的系统进化研究被引量：1
- 2009年
- 在原核生物的进化过程中,基因的横向转移(HGT)是一个重要的进化机制。为了研究HGT在噬菌体及其宿主体内的发生情况,分析多个物种的终端酶蛋白质序列。结果显示,大部分噬菌体与其宿主间的蛋白质序列中,终端酶的大、小亚基的同源性都非常之高,小亚基的序列几乎与其宿主完全一致。相比之下,噬菌体间的蛋白质序列同源性非常低。系统发生分析显示,序列相似性高的噬菌体较容易与其宿主聚集,产生寄生关系。结果表明,在噬菌体及其选择的宿主之间存在HGT,而且这种作用可能对终端酶的进化产生重要的影响。
- 沙诗宇张玮玮马飞
- 关键词：细菌噬菌体分子进化
