甘肃省自然科学基金(1010RJZA134)
- 作品数:2 被引量:11H指数:2
- 相关作者:魏彦明苏军虎杨建宝刘焕章更多>>
- 相关机构:甘肃农业大学中国科学院更多>>
- 发文基金:甘肃省重点实验室建设计划甘肃省自然科学基金甘肃省应用技术研究与开发专项计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 黄河上游极边扁咽齿鱼种群遗传结构被引量:6
- 2012年
- 极边扁咽齿鱼Platypharodon extremus是黄河上游的特有鱼类,近年来由于过度捕捞、环境变迁等因素,其资源量剧减,种群处于濒危状态。研究中采集了分布于黄河上游的3个种群(n=107),基于线粒体DNA控制区695bp序列,共检测到101个可变位点,占总分析位点的14.5%,其中58个为简约信息位点。3种群共界定了87个单倍型,种群平均单倍型多样性h=0.995,核苷酸多样性π=0.0129。结果表明,极边扁咽齿鱼的种群遗传多样性水平较高。分子方差分析(AMOVA)表明,3群体间总遗传分化系数Fst=0.0528,群体间尚未有显著的遗传分化。系统发生树显示3种群的单倍型混合分布,各进化枝之间分歧度很低,没有形成明显的单倍型组,也没有显示出单倍型与地理位置的对应关系。3个群体共享1个单倍型(Hap_31),推测它们来自于共同的祖先。歧点分布和Fu'Fs中性检测显示极边扁咽齿鱼并未经历种群扩张。
- 苏军虎张艳萍娄忠玉刘焕章焦文龙魏彦明
- 关键词:黄河上游线粒体DNA控制区种群遗传结构
- 基于线粒体控制区序列的黄河上游厚唇裸重唇鱼种群遗传结构被引量:7
- 2012年
- 采集黄河上游厚唇裸重唇鱼(Gymnodiptychus pachycheilus)甘肃玛曲群体,测定其线粒体DNA控制区序列,并从GenBank中下载青海玛多和贵德等3地2个群体的同源序列,分析该物种的遗传多样性、遗传结构及其演化历史。从81条729 bp序列中,检测到26个变异位点(占3.57%),碱基序列总的单倍型多样性为0.844,核苷酸多样性为0.0054,界定了34个单倍型,有1个广布单倍型H2,占所有样品的38.27%。单倍型网络图图显示单倍型没有明显的亲缘地理格局,H2处于中心,呈星状发散,系统发育分析没有显示出单倍型与地理位置的对应关系。AMOVA分析显示变异主要来自地理区内群体间,歧点分布和中性检测显示厚唇裸重唇鱼近期经历了种群扩张。分析表明黄河上游3地种厚唇裸重唇鱼种群未出现分化,建议应作为一个整体进行保护。
- 苏军虎张艳萍娄忠玉刘焕章焦文龙杨建宝魏彦明
- 关键词:黄河上游线粒体控制区