厦门市科技计划项目(3502Z20074036)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：罗大民徐世三张少雷倪芳更多>>
- 相关机构：厦门大学更多>>
- 发文基金：厦门市科技计划项目福建省科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 广州管圆线虫的生物信息学分析被引量：1
- 2009年
- 从GenBank下载1277条广州管圆线虫的表达序列标签(EST),用BlastX比对分析,并用SignalPV3.0预测潜在的抗原或过敏原相关蛋白N端是否具有分泌信号肽或信号锚定肽。结果显示,得分值>100有614条,其中14条与广州管圆线虫一致,540条与其他物种的相关蛋白相匹配,60条与数据库中序列无同源性。614条序列可分为10类,抗原或过敏原相关蛋白有80条,编码22种蛋白,其中12种具有分泌信号肽,3种具有信号锚定肽。
- 徐世三倪芳罗大民
- 关键词：广州管圆线虫表达序列标签
- 台湾海峡异尖线虫病病原线虫幼虫的rDNA序列分析被引量：1
- 2009年
- 目的分析台湾海峡异尖线虫病潜在病原线虫的rDNA序列,为建立病原分子生物学鉴别提供依据。方法剖检台湾海峡常见鱼类的寄生线虫幼虫,镜检分类。提取虫体DNA、用通用引物对rDNA进行PCR扩增、克隆、双向测序及BLAST比对。结果获得6条来自6种线虫幼虫的rDNA序列,其中的3种在GenBank数据库中没有发现匹配的序列;证实在台湾海峡分布的灰海鳗对盲囊线虫成虫和疑似其第三期幼虫实属同种;构建了基于ITS-2的序列间内部相似性程度关系树。结论异尖线虫病原幼虫所具有的分子生物学鉴别信息位点主要集中在ITS-2间隔区。
- 张少雷徐世三罗大民
- 关键词：RDNA
