吉林省科技发展计划基金(20130522089JH)
- 作品数：3 被引量：13H指数：2
- 相关作者：赵建军白雪闫喜军胡博张蕾更多>>
- 相关机构：中国农业科学院特产研究所青岛农业大学更多>>
- 发文基金：吉林省科技发展计划基金国家级星火计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 水貂狐狸及貉源犬瘟热病毒H基因的克隆与序列分析被引量：9
- 2014年
- 应用RT-PCR方法从2011—2013年来自我国不同地区7份水貂、狐狸和貉源犬瘟热阳性病料中克隆得到犬瘟热病毒（CDV）H基因。序列分析结果表明，7株CDV的H基因的核苷酸序列与推导的氨基酸序列的同源性分别为98．7％～100％和98．4％～100％；相应地，与Onderstepoort、CDV3疫苗株的同源性分别为90．5％～91．2％、88．99／5～91．1％。基于H基因推导的氨基酸序列构建的系统进化发生树显示，7株CDV野毒均属于Asia-1基因型。来自山东省的3株水貂和狐狸源[SD（12）1、SD（12）3和sD（12）2]CDV的H蛋白的氨基酸在第549位点由Y突变成H，此突变位于SLAM受体结合区域。此外，与其他Asia-1基因型CDV的H蛋白N-糖基化位点不同，2株水貂源CDV[SD（12）1和SD（12）3]H蛋白的受体结合区因第542位氨基酸I→N突变而增加了1个潜在N-糖基化位点NRT。这2个重要的点突变可能预示着我国某些地区CDV在进化过程中对非犬源宿主（狐狸、水貂）的适应性增强。
- 朱春生赵建军白雪张海玲胡博张蕾邵西群许皓王振军孙彦刚闫喜军
- 关键词：犬瘟热病毒血凝素蛋白水貂狐狸
- 水貂、狐狸和貉源犬瘟热病毒F蛋白信号肽区基因克隆及遗传变异分析被引量：4
- 2015年
- 为了解近年来犬瘟热病毒（canine distemper virus，CDV）在中国毛皮动物主要养殖区的流行情况及遗传变异情况，本试验于2012—2014年从山东、河北、辽宁收集疑似犬瘟热的水貂、狐狸和貉病料，经犬瘟热抗原检测试纸条检测和RT-PCR检测为阳性后，克隆测序了15株CDVF蛋白信号区（Fsp）基因序列。序列分析结果显示，15株CDV野毒株Fsp基因核苷酸序列和氨基酸序列的相似性均为93．6％～100．0％，与疫苗株相似性为80．7％～81.7％。基因系统进化分析结果显示，15株野毒株均属于中国当前流行的Asia-1基因型。氨基酸序列比对分析结果显示，Fsp蛋白在氨基酸3—14、16—37、47—67位等处存在高变异。通过对当前流行CDV野毒株Fsp基因序列分析，结果表明该Fsp基因区具有较高的变异率，可作为CDV基因分型的依据，同时本试验结果为毛皮动物犬瘟热的防控提供了参考依据。
- 孙彦刚赵建军白雪牛登云邵西群胡博刘昊张海玲张蕾王洋马凡舒闫喜军
- 关键词：水貂狐狸犬瘟热病毒
- 肉食兽类细小病毒TaqMan-MGB荧光定量PCR方法的建立与应用被引量：2
- 2013年
- 为建立检测肉食兽类细小病毒荧光定量PCR方法和探索细小病毒基因组拷贝数与病毒含量之间的相关性,在肉食兽类细小病毒VP2基因区分别设计了1对保守引物和1条TaqMan-MGB标记的水解探针,通过对貉细小病毒(RDPV)LN10-1株VP2基因上的长度为92bp的保守片段进行PCR扩增,构建标准重组质粒,由已知浓度的重组质粒通过荧光定量PCR体系建立标准曲线,建立了检测肉食兽类细小病毒基因组拷贝数的荧光定量PCR方法。结果显示,该检测方法在3.50×102～3.50×107 copies/μL范围内与Cp值呈良好的线性关系(R2可达0.999),最低检测浓度为35.0copies/μL。通过标准曲线得出RDPVLN10-1株样品的目标片段拷贝数,将拷贝数值与TCID50值进行相关性分析;分析结果显示,基因组拷贝数值与病毒TCID50值之间存在极显著的正相关关系(P<0.01),血凝效价与病毒TCID50值存在显著的正相关关系(P<0.05)。结果表明,与用血凝效价测定病毒含量的方法相比,用本试验建立的荧光定量PCR技术测得的病毒拷贝数值更能准确地代表活病毒的含量。
- 康洪涛赵建军柴秀丽胡博张海玲张蕾白雪邵西群闫喜军吴威
- 关键词：荧光定量PCRTCID50血凝效价
