公共文化服务平台

共 5 条记录，以下是 1-5

全选清除导出

排序方式：

分子动力学研究V82A和L90M变异对HIV PR-IDV复合物的影响被引量：2: 2010年; 为了说明V82A和L90M变异对蛋白酶(PR)和茚地那韦(IDV)复合物的影响,进行了5.5ns的MD模拟.用MM-PBSA方法计算了体系的结合自由能,计算和实验结果一致.分解自由能为不同能量项说明,这两个变异引起熵的贡献变化大于焓的贡献变化.分解自由能到每个残基说明Wild,V82A和L90M具有相似的结合模式,结合能的贡献主要来源于A28/A28',I50/I50'和I84/I84'这六个残基组,详细分析了Wild和IDV的结合模式,对比分析了V82A和L90M变异引起结合模式的细小变化.V82A变异引起结合模式的变化是由于变异后位阻减小导致的.L90M变异引起D25和L90间的作用增强并引起结合模式的细小变化.研究结果有助于更好地理解变异对抑制剂和HIV-1PR结合模式的影响,并可以用来帮助设计更高效的PR抑制剂.; 扈国栋陈建中时术华伊长虹张少龙张庆刚; 关键词：分子动力学模拟

He+H_2^+→He H^++H反应的从头算势能面被引量：2: 2010年; 运用多参考组态相互作用(MRCI)方法及aug-cc-pv5z基组构造了HeH_2^+体系基态(1~2A′)从头算势能面.采用多体展开法共拟合了8840个能量点,拟合误差为0.0677 Kcal/mol.基于新势能面,采用准经典轨线方法计算了碰撞能在0～2 eV范围内的积分反应截面,计算结果与实验结果符合较好.; 梁景娟刘新国许文武孔浩张庆刚; 关键词：从头算势能面

O^+ + H_2及其同位素取代反应的立体动力学研究被引量：1: 2010年; 运用准经典轨线方法,基于RODRIGO势能面,对碰撞能为20kcal/mol时,O++H2及其同位素取代反应的立体动力学性质进行了理论研究,对k-j′两矢量相关和k-k′-j′三矢量相关的分布函数、极化微分反应截面,以及产物转动取向参数进行了详细的讨论.结果表明,O++H2→OH++H,O++DH→OD++H和O++TH→OT++H反应的立体动力学性质对体系的质量因数非常敏感.; 刘新国孙海竹刘会荣张庆刚; 关键词：立体动力学准经典轨线方法矢量相关

H^-+H_2体系的从头算势能面及准经典轨线研究被引量：1: 2010年; 采用多参考组态相互作用(MRCI)方法对H-+H2体系进行了构型优化及8116个构型能量点的扫描,运用多体展开法对能量进行了解析拟合得到了该体系的从头算势能面,拟合得到的均方根误差为0.27kcal/mol.基于新势能面,采用准经典轨线方法计算了D-+H2和H-+D2两个反应碰撞能在0~2.4eV范围内的积分反应截面,并且对计算结果与实验结果进行了比较.; 刘新国许文武张庆刚; 关键词：从头算势能面准经典轨线

分子动力学模拟和自由能计算研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式(英文)被引量：7: 2010年; 孕酮在确立和维持妊娠中起到了关键的作用.为了研究孕酮和孕酮受体蛋白的结合模式,进行了3.5纳秒的分子动力学模拟,用MM-PBSA\GBSA方法计算了结合自由能.自由能分解和丙氨酸扫描两种方法说明,残基Leu718,Met756,Met759,Phe778和Tyr890对于结合抑制剂作用明显,这些残基的主要作用能是范德瓦尔斯作用能.这一研究结果可以指导孕酮受体蛋白抑制剂的优化.; 扈国栋张少龙刘新国张庆刚; 关键词：孕酮受体分子动力学

全选清除导出

共1页<1>

山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(2008BS01013)