重庆市卫生局科研项目(2011-2-405)
- 作品数：2 被引量：9H指数：2
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- HLA-A新等位基因A^＊01：01：51的DNA序列分析被引量：2
- 2013年
- 目的分析HLA-A*01∶01∶51新等位基因的序列。方法应用SBT基因分型技术,通过位点特异性PCR扩增和组特异性PCR扩增,对扩增产物进行HLA-A基因的第2、3、4外显子双向测序,将测序结果与数据库进行比对,确认突变的位置。结果组特异性引物扩增结果显示A位点有2个等位基因,其中1个为A*02∶07∶01,另1个为新等位基因。经BLAST分析,新等位基因与HLA-A*01∶01∶01∶01序列仅在第4外显子上有1个碱基不同,即第762位C→T,254位氨基酸CTC→CTT,氨基酸没有改变,仍为亮氨酸。新等位基因序列已递交Genebank(JX629459)。结论该HLA-A新等位基因于2012年9月被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为A*01∶01∶51。
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- 重庆汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因多态性研究被引量：7
- 2014年
- 目的分析重庆地区汉族人群HLA-A、B、DRB1在高分辨基因分型水平上多态性及分布特征。方法采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)基因分型以及基因序列分型(SBT)技术,对重庆地区2 067例无关供者的HLA-A、B、DRB1位点上的等位基因进行高分辨分型,直接计数法计算等位基因频率,应用Arlerquin3.1软件进行Hardy-Weinberg平衡检验。结果共检出了168种HLA高分辨等位基因。其中HLA-A位点42种,频率大于0.05有A*11:01,A*24:02,A*02:07,A*02:01,A*33:03;HLA-B位点81种,频率大于0.05有B*46:01,B*40:01,B*58:01,B*13:01,B*15:02;HLA-DR位点45种,频率大于0.05有DRB1*09:01,DRB1*15:01,DRB1*12:02,DRB1*08:03,DRB1*11:01。结论获得了重庆地区汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因频率数据,为人类学、法医学、移植配型及疾病相关性等研究提供可靠的参考数据。
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- 关键词：HLA抗原基因频率
