国家自然科学基金(30771878)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：程训佳付永峰林育涛杨彬更多>>
- 相关机构：复旦大学上海医学院东海大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 几种肠道原虫主要表面蛋白的研究进展被引量：1
- 2008年
- 在溶组织内阿米巴、隐孢子虫和蓝氏贾第鞭毛虫的致病过程中,一些表面蛋白发挥着重要的作用,介导了原虫与宿主细胞的粘附以及侵入宿主细胞的过程,本文综述了其主要表面蛋白的研究进展以及在诊断和治疗中的应用。
- 杨彬程训佳
- 关键词：肠道原虫表面蛋白
- 5株内阿米巴14-3-3蛋白序列比较及生物信息学分析被引量：1
- 2008年
- 目的比较具有不同致病性以及毒力的5株内阿米巴的14-3-3蛋白序列,并选取溶组织内阿米巴HM1∶IMSS株进行相关生物信息学预测,用以指导进一步实验研究。方法收集各虫株滋养体的基因组DNA,根据Gen-Bank收录的溶组织内阿米巴编码基因序列设计特异引物,以基因组DNA为模板扩增目的基因片段,测序后利用生物信息学网站的各种在线分析工具和Genetyx软件ver 13.0,对所得序列进行比较,构建分子进化树,并对溶组织内阿米巴HM1∶IMSS株的14-3-3蛋白进行相关的生物信息学分析。结果5株内阿米巴属虫株均含有3个14-3-3基因,编码的氨基酸序列同源性较高,个别位点存在差异。取溶组织内阿米巴HM1∶IMSS株14-3-3-1序列与其他物种的同源蛋白比较并构建分子进化树,与种系进化过程非常吻合。根据生物信息学分析结果预测,溶组织内阿米巴HM1∶IMSS株14-3-3-1含720个碱基,编码239个氨基酸;14-3-3-2含717个碱基,编码238个氨基酸;14-3-3-3含723个碱基,编码240个氨基酸。3种异构体都带有2个14-3-3蛋白家族标记,含有多个潜在的磷酸化位点,但不含线粒体、过氧化物酶体等细胞器定位序列以及信号肽。该蛋白在大肠埃希菌中表达的半衰期>10 h。结论内阿米巴属14-3-3基因高度保守。生物信息学分析结果提示14-3-3蛋白是研究物种进化的理想分子。
- 林育涛付永峰程训佳Hiroshi Tachibana
- 关键词：溶组织内阿米巴生物信息学
