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广东省自然科学基金(2006129)
作品数:
1
被引量:4
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相关作者:
杨川
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黄忠
刘红燕
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2007
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中国人PGC-1α基因全外显子cSNPs分析及其MEF2C结构域生物学信息预测
被引量:4
2007年
目的了解中国人PGC-1α基因全外显子编码区单核苷酸多态性(cochng single nucleotide polymowhis,cSNPs)分布特征,探讨相关cSNPs与2型糖尿病的关系,并对PGC-1α蛋白肌肉增强因子2C(muscle enhance factor2C,MEF2C)结构域的生物学信息进行预测。方法应用聚合酶链反应.单链构象多态性、聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和DNA直接测序技术检测263例2型糖尿病患者和282名正常糖耐量者PGC-1α基因全外显子cSNPs,应用病例一对照方法探讨相关cSNPs及其单倍型与2型糖尿病发病风险的相关性,并经软件预测PGC-1α基因包含有482位点的MEF2C结构域的3级X-ray衍射晶体结构,分析其可能的生物学信息。结果中国汉族2型糖尿病人群PGC-1α基因全外显子区至少存在4个单核苷酸多态性位点,分别是394G/A、482G/A、528A/G和612C/T。482G/A变异与2型糖尿病显著相关(X^2=14.2025,P=0.0002)。单倍型分析提示394A-482A-528A单倍型在2型糖尿病组与正常糖耐量组分布差异有统计学意义(X^2=59.9,P〈0.01),且与2型糖尿病呈连锁不平衡(t=2.361,P〈0.05)。分子模拟了人PGC-1α蛋白MEF2C结构域的3级X-ray衍射晶体结构,当482位变异成丝氨酸时,该结构域疏水性下降,并伴有氢键断裂,空间结构趋向松散。结论482G/A变异可能减弱了PGC-1α与MEF2C结合力,进而减弱了PGC-1α对下游基因GLUT-4表达的调控,从而经PGC—1α-MEF2C—GLUT-4通路增加了中国汉族人患2型糖尿病的风险。
路文盛
颜晓东
刘红燕
黄忠
谭小燕
黄勤
杨川
李焱
严励
程桦
关键词:
PGC-1Α基因
分子模拟
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