浙江省自然科学基金(Y305222)
- 作品数：3 被引量：36H指数：2
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- 下一代测序cDNA样品制备及优化技术探讨
- 2010年
- 下一代测序技术目前已经应用于微生物、人类、动物、植物等的基因组分析。样品制备是开展大规模测序的必要前提和测序成功的根本保证。对大规模测序造成干扰的主要因素有:polyA干扰测序信号及高丰度基因对低丰度基因的掩盖等。文章以堇菜(Viola verecumda A.Gray)叶片为试材,提取总RNA,合成双链cDNA,利用DSN核酸酶对双链cDNA进行均一化处理,并对双链cDNA polyA进行了切除,将处理后的cDNA进行了TA克隆,挑取100个克隆随机测序。结果表明,未处理的cDNA样本测序有15个克隆由于polyA的存在而影响了附近碱基的正确阅读,独立克隆只有62个,而处理后的cDNA样本经测序未发现polyA,独立克隆有94个。序列分析发现,经过处理的cDNA样本随机测序有两个克隆是经MALDI-TOF检测在样本中有蛋白质峰,而基因克隆一直没有分离到的序列。以处理后的cDNA样本为模板扩增2个已知表达丰度差异较大的基因显示,处理后这2个基因的PCR扩增产量差异明显减小。这些结果表明polyA切除、DSN核酸酶处理的cDNA样本完全满足大规模测序、寻找新基因的要求。
- 秦巧平张岚岚李南羿崔永一徐凯
- 关键词：CDNA下一代测序
- 枇杷果实糖酸积累的分子生理机制被引量：31
- 2012年
- 糖酸含量及糖酸比是果实品质的重要指标。糖不仅决定果实甜度,也是色素、氨基酸、维生素和芳香物质等其他营养成分合成的基础原料。果实有机酸与糖一起形成糖酸比,决定果实风味,同时,果实有机酸作为呼吸底物为合成其他物质提供基础。糖酸比是影响果实口感的最主要因子。对糖酸代谢机制的阐明可为果树栽培管理及高品质育种提供理论依据。文章综述了近年来国内外有关枇杷Eriobotrya japonica糖酸代谢的生理学、分子生物学及栽培措施对糖酸积累的影响等方面的研究进展,并结合笔者的研究经验提出未来在枇杷糖酸代谢机制与调控方面的主要研究重点:进一步明确栽培措施和环境因子对果实糖酸代谢的影响及分子机制;探明果实糖、酸运输的分子机制;应用遗传工程调控果实糖酸组成;探明糖积累与酸积累的相互作用机制。
- 秦巧平林飞凡张岚岚
- 关键词：园艺学枇杷果实有机酸代谢机制
- APETALA3/DEFICIENS和PISTILLATA/GLOBOSA基因与植物花发育被引量：5
- 2006年
- APETALA3(AP3)/DEFICIENS(DEF)和PISTILLATA(PI)/GLOBOSA(GLO)为植物花器官发育B类基因,控制双子叶植物花瓣和雄蕊的发育,它们属于MADS-box基因家族,编码转录因子,这些基因的突变能导致花瓣转变为萼片,雄蕊转变为心皮。近年来已经在多种植物中克隆到了AP3/DEF和PI/GLO基因,AP3/DEF和PI/GLO基因在拟南芥中只在花器官中表达,而在玉米等植物维管束、叶片等组织中也有表达。现对有关AP3/DEF和PI/GLO基因表达及其在植物系统发育学研究方面的进展进行综述。
- 秦巧平尹涛陈俊伟谢鸣张上隆
- 关键词：基因表达花发育
