国家自然科学基金(81172741)
- 作品数：3 被引量：6H指数：2
- 相关作者：刘艳张文驰杜瑞琴高青王爽更多>>
- 相关机构：哈尔滨医科大学中国人民解放军第二炮兵总医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于非参数正态图模型的差异网络分析——肝细胞癌生存时间枢纽基因的筛选被引量：2
- 2019年
- 目的评价基于非参数正态图模型的差异网络分析方法筛选差异基因的效果,并筛选影响肝细胞癌患者生存时间的枢纽基因,用于预测患者的预后或作为新的药物靶点。方法模拟实验中用AUC值评价基于非参数正态图模型的差异网络分析筛选差异基因的效果,再从TCGA数据库下载3个平台5个数据集的肝细胞癌患者的基因表达数据,纳入通路等先验信息利用非参数正态图模型构建差异表达网络,按照节点连接边的个数即度的大小选择枢纽基因。结果在4种条件的模拟实验中,非参数正态图模型筛选差异基因的AUC值范围为0.71～0.97;在肝细胞癌数据的分析中,筛选出8个与肝细胞癌生存时间相关的枢纽基因,分别是IGF1、ErbB2、FGF9、GH2、cSH2、HSP90AA1、PPP2R5B和EPO。结论基于非参数正态图模型的差异网络分析方法在模拟实验中筛选差异基因的效果较好,在实例数据分析中筛选的肝细胞癌生存时间相关的枢纽基因都有较为明确的生物学功能。
- 李晶张奇任雨冬刘艳
- 关键词：肝细胞癌
- 前列地尔联合丹红注射液治疗糖尿病周围神经病变的疗效分析被引量：4
- 2013年
- 目的:探讨前列地尔联合丹红注射液治疗糖尿病周围神经病变的效果,为治疗糖尿病周围神经病变提供临床依据。方法:采用回顾性调查的方法,选取我院2011年1月-2012年12月收治的糖尿病周围神经病变150例,分为前列地尔联合丹红注射液组(联合治疗组),前列地尔组和丹红组,每组各50例。结果:联合治疗组总有效率为94.00%(47/50),高于丹红组86.00%(43/50)和前列地尔组88.00%(44/50)(P<0.05);联合治疗组显效率为68.00%(34/50),高于丹红组60.00%(30/50)和前列地尔组60.00%(30/50);联合治疗组无效率为9.00%(3/50),低于丹红组14.00%(7/50)和前列地尔组12.00%(6/50)(P<0.05);三组治疗后正中神经和腓总神经MNCV和SNCV均高于治疗前,差异有统计学意义(P<0.05);联合治疗组治疗后均高于丹红组和前列地尔组治疗后,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:前列地尔联合丹红注射液可有效提高正中神经和腓总神经MNCV和SNCV,对改善糖尿病周围神经病变效果较好。
- 颜艳李全民孙亚欧高青李琳王爽杜瑞琴栾然张文驰
- 关键词：前列地尔丹红注射液糖尿病周围神经病变
- 基于真实SNPs数据的仿真方法实现与效果评价
- 2017年
- 目的探讨基于真实单核苷酸多态性(SNPs)数据有效的计算机仿真方法,为探索SNPs与疾病的关联研究,基因-基因交互作用研究提供帮助。方法利用gs2.0软件实现真实SNPs数据的仿真,利用Haploview、Plink、MDR软件对仿真效果进行评价。结果利用gs2.0以中国傣族人群第22号染色体的500、1 000、5 000个SNPs位点为原始数据,分别生成了含有单致病位点和两交互作用致病位点的仿真数据。通过比较发现原始数据与其仿真数据的LD模式基本相似,有接近的r^2值,单致病位点的差异显著性明显,两交互作用致病位点能被MDR识别。结论 gs2.0是一个简单高效的计算机仿真软件,能较好地仿真SNPs的LD模式并能准确设置单致病位点和两交互作用位点用以批量生成SNPs仿真数据。
- 刘芸良肖纯史晓雯刘艳
- 关键词：数据仿真单核苷酸多态性
