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广西壮族自治区自然科学基金(0728003): 作品数：9 被引量：60H指数：5; 相关作者：磨美兰李孟韦平韦天超陈秋英更多>>; 相关机构：广西大学广西师范学院更多>>; 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金国家自然科学基金广西壮族自治区科技攻关计划更多>>; 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>

IBV地方分离株GX-YL5在鸡体内动态分布和排毒规律及组织嗜性研究: 鸡传染性支气管炎(infectious bronchitis,IB)是由冠状病毒科冠状病毒属的鸡传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus,IBV)引起的鸡急性高度接触传染性呼吸道疾病。I...; 磨美兰陈秋英朗亚辉黄柏成侯金莲韦平韦天超; 关键词：传染性支气管炎病毒排毒规律组织嗜性; 文献传递

广西不同时期IBV分离株S1和N基因的序列和系统进化分析: 为了解广西传染性支气管炎病毒（IBV）的纤突蛋白S1基因高变区Ⅰ（HVRⅠ）和核（N）蛋白基因变异情况及S1和N基因变异间的相关性,本研究应用RT-PCR方法扩增了广西1985—2008年的21株IBV的S1基因HVRⅠ...; 磨美兰李孟韦正吉陈秋英范文胜郎亚辉黄柏成韦平韦天超; 关键词：鸡传染性支气管炎病毒 N基因系统进化分析基因突变基因重组; 文献传递

复杂网络的统计机制及生物网络的发展: 2007年; 介绍了复杂网络发展的动力学理论及对生物网络的发展和已经取得的成果进行了归纳和总结。最后利用复杂网络理论建立了一个由不同密码子tRNA序列组成的相似度网络,并研究了网络的拓扑结构和分析其中隐藏的进化信息。; 韦芳萍蓝贞雄; 关键词：复杂网络生物网络

tRNA序列的进化网络研究被引量：1: 2009年; 根据tRNA序列的反密码子,把3420条tRNA序列分成了21组,其中包括20组氨基酸及1组Stop。通过tRNA序列的相似度构建了1组整体网络和21组子网络,并计算了它们在不同相似度下的平均度、平均聚类系数以及平均最短路径。通过分析、比较和讨论网络中的三个重要参数,进一步说明点突变是tRNA序列进化的重要机制,并反映了它们的进化近似符合中性理论,且在同一组氨基酸和Stop内的tRNA序列在进化历史上的同源关系更密切;同时表明了tRNA序列在进化过程中具有自相似性。; 陈伯文夏玉显韦芳萍; 关键词：反密码子相似度网络

动物传染病研究中PCR引物设计的技巧及相关软件介绍被引量：11: 2008年; 引物设计是PCR技术中最重要的一环。本文就引物设计前的准备工作、引物设计原则、引物设计软件和方法等相关问题,介绍在动物传染病研究中设计PCR引物的一些应用体会。; 磨美兰甘书钻; 关键词：聚合酶链式反应引物设计

广西1985年～2008年IBV分离株S1基因高变区Ⅰ和N基因的序列和系统进化分析被引量：16: 2009年; 为了解广西传染性支气管炎病毒(IBV)的纤突蛋白S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)和核(N)蛋白基因变异情况及S1和N基因变异的相关性,本研究应用RT-PCR方法扩增了广西1985年～2008年的21株IBV的S1基因HVRⅠ和N基因,并进行了克隆、序列测定及分析。结果发现:广西存在着多种基因型IBV流行;广西IBV分离株S1基因存在广泛的点突变和插入现象;N基因序列存在氨基酸替代现象。21株IBV中12株在S1基因HVRⅠ和N基因遗传进化树中均归属相同群,其余毒株却归属不同的群。2005年分离的GX-NN5存在基因重组现象。以上结果表明了广西IBV毒株存在基因突变和基因重组现象,S1和N基因的变异不完全平行,有些毒株间的S1和N基因差异很大。; 磨美兰李孟韦正吉陈秋英范文胜郎亚辉黄柏成韦平韦天超; 关键词：鸡传染性支气管炎病毒 N基因系统进化分析基因突变基因重组

引起免疫失败的IBV分离株的生物学特性及结构基因分析被引量：5: 2009年; 本研究应用鸡胚尿囊腔接种的方法,从广西患传染性支气管炎的免疫失败的病鸡中分离到一株传染性支气管炎病毒(IBV)(命名GX-YL5),通过间接血凝试验、动物回归试验和气管环交叉中和试验对该毒株进行鉴定和主要生物学特性的研究,同时利用RT-PCR技术扩增克隆该病毒的S1基因和N基因并测定其核苷酸序列。结果表明:该病毒株有间接血凝性;致病性较强;血清型不同于常用疫苗株H120、Ma5、4/91。同源性分析表明,S1基因核苷酸和氨基酸序列与参考株的同源性分别为63.5%～81.2%和50.7%～78.8%;N基因核苷酸和氨基酸序列与参考株的同源性分别为85.7%～87.2%和89.5%～91.7%;S1基因和N基因系统进化分析表明分离株与其它参考毒株的亲缘关系较远。S1基因和N基因分型与血清学试验结果相吻合。本研究结果提示了广西分离株GX-YL5可能是一个新的变异株,这可能是目前免疫失败的重要因素,同时也为研制适合本地使用的IBV疫苗提供了科学依据和物质基础。; 磨美兰李孟陈秋英王秀英范文胜韦正吉韦平韦天超; 关键词：生物学特性结构基因

鸡传染性支气管炎病毒广西分离株血清型的分析被引量：15: 2010年; 应用病毒感染的鸡胚材料免疫新西兰兔的方法制备抗鸡传染性支气管炎病毒(IBV)单因子血清,然后在鸡胚气管环培养(Tracheal organ cultures,TOC)上对广西分离的7个IBV代表性毒株和3个常用疫苗株进行交叉病毒中和试验。结果显示,10个毒株被分为6个血清型。根据试验所得的R值,应用聚类分析法分析了各血清型毒株之间的亲缘关系,显示目前在广西流行的IBV野毒株之间以及其与疫苗株间的抗原性存在很大程度的差异,分属不同的血清型。同时还对IBV基因分型和血清分型之间的关系进行了探讨。; 王秀英韦平陈秋英李孟磨美兰张胜斌韦飞妮; 关键词：鸡传染性支气管炎病毒气管环组织培养血清型抗原变异聚类分析

利用cvTree方法构建及分析tRNA序列的亲缘关系进化网络被引量：4: 2011年; 本文利用cvTree和复杂网络理论相结合的方法,构建了3420条tRNA序列亲缘关系进化网络。计算了相关网络的平均度、平均聚类系数和平均最短路径随进化距离Dis变化的关系。同时还分析和讨论了tRNA序列之间的亲缘关系及其进化机制,观察到一个与其它方法不同的结果:随着亲缘距离Dis的增加,网络的度分布先是从power-law分布转变为Gussian分布,然后又从Gussian分布转变为反power-law分布。本研究结果说明由cvTree方法和复杂网络理论相结合的方法研究tRNA基因序列的进化的结果也许更加符合其进化历程。; 毛源泽韦芳萍王俊美刘强; 关键词：复杂网络

广西不同时期IBV分离株S1基因高变区Ⅰ的遗传变异分析被引量：24: 2008年; 对广西1985-2007年间分离到的22株传染性支气管炎病毒（IBV）的S1基因高变区I（HVRI）进行序列测定，并与发表的其他IBV参考株及鸽子分离的冠状病毒株的基因序列进行比较和分析。系统进化关系显示毒株可分为5个基因群，其中有16个广西分离株属第1群，它们与鸽子冠状病毒分离株的氨基酸序列同源性较高，与Massachusetts（Mass）型疫苗株的同源性较低。有15个分离株在33-34位和34～35之间分别有4个和3个氨基酸残基的插入，GX-NN6在33～34位和34～35位之间则均有4个氨基酸残基的插入；GX-YL1、GX-NN2与常用的Mass型疫苗株的亲缘关系最近，同属于第Ⅱ群；GX-G、GX-XD与日本同一时期分离的毒株JP Miyazaki 89亲缘关系最近，属于第Ⅲ群；GX-YL6、GX-NN7与欧洲毒株4／91亲缘关系较近，属于第V群。结果表明广西存在着多种类型IBV毒株的流行，毒株S1基因HVRI碱基的突变或插入比较普遍，可导致其氨基酸序列的变化，绝大部分毒株与目前常用的Mass型疫苗株的亲缘关系较低。同一时期的分离株同源性较高，但无明显的地域性差异。; 韦正吉韦平磨美兰李孟韦天超李康然; 关键词：传染性支气管炎病毒分离株基因型

广西壮族自治区自然科学基金(0728003)

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