国家自然科学基金(40172005)
- 作品数：8 被引量：149H指数：4
- 相关作者：刘中来赖旭龙张志敏钟华王慧娟更多>>
- 相关机构：华中师范大学中国地质大学遵义医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学天文地球医药卫生更多>>
- 利用DNA序列构建系统树的方法被引量：58
- 2004年
- 利用DNA序列进行系统发生分析是分子进化研究的必要手段。构建系统树的方法有距离法、简约法、最大似然法以及贝叶斯推断法等。要解决特定的系统发生问题,首先要挑选合理的分类群及序列,尽量减少数据的偏倚,然后选择构树方法,最后还要对结果进行评价并给出进化学上的解释。通过讨论挑选数据的原则及存在的问题,介绍了几种构树方法的基本原理及步骤,并列举了它们的优缺点。
- 李涛赖旭龙钟扬
- 关键词：DNA序列系统树分子进化
- EST的应用现状与前景被引量：20
- 2003年
- 综述EST(Expressedsequencetag)的用途、应用现状及其发展前景。
- 钟华谢婷婷刘中来
- 关键词：表达序列标签CDNAEST数据库
- 大熊猫的分类与演化综述被引量：8
- 2004年
- 从化石记录和分子生物学证据方面探讨了大熊猫分类和演化的研究现状及进展。归纳和介绍了大熊猫种和亚种的划分及其主要鉴别特征、分布时限、不同地史时期大熊猫的地理分布;根据牙齿特征的细微差别将大熊猫划分为5个主要的种和亚种;根据大熊猫各种和亚种时空分布及其形态的渐变过程,得出了禄丰始熊猫→大熊猫小种→大熊猫武陵山亚种→大熊猫巴氏亚种→大熊猫现生种的演化谱系图;由于大熊猫与熊类、浣熊类在形态及遗传学上均表现出一定的相似性,因而在"科"级水平上大熊猫的归属出现了较大的争执,主要有三种观点:大熊猫属于熊科,大熊猫属于浣熊科,大熊猫自成一科,并列举了各自的证据;指出了大熊猫分类和演化研究中存在的问题,并展望了古DNA和食性研究在大熊猫分类中的应用。
- 李涛赖旭龙王頠周修高
- 关键词：大熊猫地理分布古DNA
- HBV X区基因部分序列的亚克隆与PCR检测
- 2006年
- 目的:探讨HBV X区基因用于乙型病毒性肝炎早期诊断价值和意义。方法:设计特异性引物,将pBR322-HBV质粒X区部分序列PCR产物AT亚克隆至pBS-T载体,提取和纯化质粒DNA,再对HBV X区序列进行PCR扩增。结果:获得了预期希望的质粒。PCR的最佳退火温度为51℃,灵敏度达到101拷贝/2μl,线性范围101-1010拷贝/2μl。讨论:pBR322-HBV质粒中的靶基因成功地被亚克隆至pBS-T载体。pBR322-HBV中X区目的序列扩增产物为57bp,该小片段勿需纯化就可直接AT亚克隆至新载体,有利于后续的常规PCR检测和TaqMan MGB荧光定量PCR检测。
- 袁媛陈强杨继红熊国梅刘中来
- 关键词：乙型肝炎病毒亚克隆灵敏度
- 亚洲黑熊活化素βA亚基基因克隆及分子进化分析被引量：2
- 2008年
- 借鉴互联网中已克隆的活化素βA亚基基因的序列,设计并合成一对兼并引物,首次扩增和克隆到亚洲黑熊βA亚基基因的357 bp片段,以水作为阴性对照排除污染,多次重复实验获得一致稳定结果.序列分析显示此片段在处于不同进化程度的物种之间,仍然具有高度的保守性,亚洲黑熊βA亚基基因与人相比有29个核苷酸差异,一致性高达91.6%;与亲缘关系较近的大熊猫、小熊猫和马来熊相比,分别有4、20、3个核苷酸差异,一致性分别为98.9%、94.4%、99.2%.系统发育分析和酶切图谱分析显示亚洲黑熊、大熊猫和马来熊具有较近的亲缘关系,而它们与小熊猫的亲缘关系较远.
- 张志敏肖代敏李学英刘中来
- 关键词：亚洲黑熊亚基基因分子进化
- 黑素皮质素受体-2与Ⅰ型家族性糖皮质激素缺乏症被引量：1
- 2007年
- 黑素皮质素受体-2（MC2R）具有7个跨膜区（Ⅰ～Ⅶ）、3个胞外环和3个胞内环，人MC2R基因定位于18p11．2；编码区长894bp，无内含子，在种间和种内具有较高保守性；人MC2R有297个氨基酸残基，推测分子量为33kD．MC2R主要分布于肾上腺皮质区网状带和束状带，在功能上与腺苷酸环化酶偶联，通过激活依赖环腺苷酸的信号途径来催化类固醇合成；MC2R合成受到各种因子调节，包括其自身配体ACTH、顺式作用元件和反式作用因子等．MC2R基因突变可导致工型家族性糖皮质激素缺乏症；迄今为止，在FGD患者中共发现37个MC2R基因编码区突变，突变单独或复合存在降低MC2R活性．
- 张志敏肖代敏王慧娟刘中来
- 关键词：基因突变
- 一种从大熊猫粪便中提取DNA的改进方法被引量：58
- 2003年
- 本研究描述一个改进的方法 ,使从大熊猫粪便中提取DNA用于PCR扩增变得更加容易。在粪便DNA的提取过程中采用一个新的预处理方法 ,将粪便用预冷的丙酮洗 2～ 3次 ,除去粪便中含有的大量PCR抑制物 ,然后用蛋白酶K裂解、酚 -氯仿抽提 ,能提取到纯度很高的DNA供PCR扩增。本实验PCR扩增了大熊猫脑源性神经营养因子 (BDNF)基因和线粒体细胞色素b基因片段 ,并进行测序分析 ,证实了提取的可靠性。对比本方法和未经丙酮预处理的方法提取的DNA进行PCR扩增 。
- 钟华赖旭龙魏荣平刘中来
- 关键词：大熊猫粪便DNA丙酮DNA抽提非损伤性取样
- 粪便取样对亚洲黑熊脑源性神经营养因子基因全长序列分析被引量：4
- 2006年
- 沿用本室改进的粪便提取方法,参照马来熊BDNF基因序列设计引物,首次从亚洲黑熊粪便DNA中扩增和克隆到包含完整核BDNF基因的753 bp片段,以毛发作阳性对照并进行重复实验,获得稳定一致结果。序列分析表明,亚洲黑熊的BDNF基因非常保守,与人相比,一致性达94.5%,与大熊猫比达98.9%。在推导的多肽序列中,其成熟区氨基酸序列与所有已报道哺乳动物的完全一致;对亚洲黑熊及其相关物种BDNF基因序列的比较分析,发现大熊猫与包括黑熊在内的熊科动物亲缘关系更近,而与小熊猫较远。文章首次采用非损伤性取样法在分子生物学水平对亚洲黑熊基因组核BDNF基因进行分析,不仅为亚洲黑熊的保护和繁育提供重要参考资料,为非损伤性取样在珍稀濒危野生动物研究中的应用拓宽了思路,也为亚洲黑熊及其近缘种的系统分类研究提供分子证据。
- 张志敏王慧娟刘中来熊国梅
- 关键词：亚洲黑熊粪便DNA脑源性神经营养因子基因非损伤性取样
