河南省教育厅科学技术研究重点项目(13A230470)
- 作品数：2 被引量：5H指数：2
- 相关作者：李国喜陈功义刘变枝高春生赵银丽更多>>
- 相关机构：河南农业大学河南农业职业学院河南工业大学更多>>
- 发文基金：河南省教育厅科学技术研究重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 鲤鱼脾脏中保守miRNA的鉴定被引量：3
- 2015年
- miRNA参与动物免疫系统发育及功能调节,但与鲤鱼免疫相关的miRNA研究还未见报道.为鉴定鲤鱼免疫相关mi RNA,本研究构建了鲤鱼脾脏小RNA文库.通过Solexa测序,共获得纯净序列读数10 603 456条.经过生物信息学分析,鉴定到192种保守miRNA,其中69种为新的鲤鱼mi RNA.表达分析表明,高丰度mi RNA主要集中于let-7、mir-10、mir-15和mir-30等30余个基因家族.mi RNA保守性分析显示,23个家族在原口和后口动物中均存在,46个家族仅在脊椎动物中保守,5个家族仅在鱼类中被鉴定到.此外,GO富集分析表明,鲤鱼脾脏保守mi RNA与免疫系统发育、淋巴细胞活化、免疫应答等相关.本研究首次鉴定了鲤鱼脾脏组织mi RNA转录组谱,增加了鲤鱼已知mi RNA数量,有助于更好地理解鲤鱼免疫防御机制.
- 陈功义赵银丽李国喜刘变枝高春生
- 关键词：鲤鱼脾脏MIRNA
- 鸡miR-148a的组织表达及其发育调控功能预测分析被引量：2
- 2013年
- 为了解鸡miR-148a组织表达谱和潜在发育调控功能,采用茎-环定量RT-PCR检测了固始鸡5个发育阶段、15种组织中miR-148a的表达,利用Pictar和TargetScan算法预测了miR-148a的靶基因,并对预测靶基因分别进行了Gene Ontology分析和通路分析.结果显示,miR-148a的表达具有明显的时序特征,胚胎期各组织中的表达水平明显低于出壳后;miR-148a在出壳后的大脑、小脑、延脑、腺胃、小肠、肝、胰和胸肌等器官组织中的表达水平随着发育进程被显著上调;miR-148a预测靶基因在胚胎器官形态发生、血细胞生成、消化道形态发生、心血管发育、感觉器官发育、肠发育、骨骼系统发育、后脑发育、呼吸系统发育、免疫系统发育、淋巴器官等发育过程显著富集.总之,鸡miR-148a为广泛性表达miRNA,可能参与鸡诸多器官组织发育过程的调控.
- 李国喜闫峰宾王乐乐贾丽娟孙桂荣康相涛
- 关键词：功能分析
