国家自然科学基金(30670046)
- 作品数：5 被引量：5H指数：2
- 相关作者：王莉陈雯莉张鹏李东霞胡璠更多>>
- 相关机构：华中农业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 鱼腥蓝细菌PCC7120 alr3504基因缺失突变体的构建及表型分析
- 2008年
- c-di-GMP是新发现的真细菌所特有的第二信使,其合成和降解由双鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶分别完成。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC7120基因alr3504可能编码含有保守GGDEF结构域的双鸟苷酸环化酶。【目的】为了鉴定该基因的功能,【方法】采用标记置换方法将alr3504缺失。【结果】敲除该基因后,发现缺失突变体的形态、生长速度及异形胞发育与野生型无明显差异,但在盐胁迫条件下,突变体比野生型对钠盐更敏感。【结论】可见alr3504虽不直接影响异形胞发育,但参与了其它信号途径,研究结果为阐明蓝细菌丰富而复杂的信号转导机制奠定了基础。
- 戴燕王莉陈雯莉
- 关键词：磷酸二酯酶
- 蓝细菌中与PⅡ蛋白或NtcA蛋白相互作用的PipX蛋白的生物信息学分析被引量：2
- 2010年
- 应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站与生物信息学软件对蓝细菌各菌株的PipX进行多序列同源对比分析,获得保守序列,预测了二级结构与结构域,分析了pipX的基因簇等。分别构建了蓝细菌的16S rDNA进化树以及基于PipX的分子进化树,同时也对与PipX相互作用的NtcA和PⅡ构建分子进化树进行了比较分析,了解它们之间起源与进化的关系。由此推测PipX可能是蓝细菌氮代谢途径中除NtcA、PⅡ外的另一个关键调控蛋白,有着重要的生理功能。
- 张鹏王莉陈雯莉
- 关键词：生物信息学蓝细菌
- 钙化裂须蓝细菌schetR基因超表达菌株的构建及表型分析被引量：1
- 2010年
- 为研究在不分化异形胞的钙化裂须蓝细菌Schizothrixcalcicola中schetR基因的功能,本研究构建由强启动子petE驱动的schetR基因的表达质粒,通过三亲本接合转移的方法将此表达质粒转入模式生物鱼腥蓝细菌AnabaenaPCC 7120的hetR突变体中进行功能验证。结果显示:超表达schetR能够互补鱼腥蓝细菌hetR突变体的表型,这说明schetR能够促进异形胞的发育。
- 胡璠王莉陈雯莉
- MreB在鱼腥蓝细菌PCC 7120细胞分裂过程中的功能被引量：2
- 2012年
- 为研究Anabaena sp. PCC 7120中的细胞形态决定蛋白MreB的亚细胞定位和功能,构建了由mreB自身启动子驱动的mreB-gfp融合载体,通过接合转移的方法将其转化到野生型Anabaena sp. PCC 7120中,获得绿色荧光蛋白标记的MreB的鱼腥蓝细菌菌株,同时用MreB的抑制剂A22处理菌株。结果显示,MreB的亚细胞定位随着细胞周期的进程而发生变化,A22处理可导致MreB无法正确聚合定位。
- 李东霞王莉陈雯莉
- 关键词：MREB细胞分裂
- 鱼腥蓝细菌PCC 7120中一个受到NtcA调控的基因alr1390被引量：1
- 2010年
- NtcA是鱼腥蓝细菌中一种重要的氮代谢调控蛋白质,参与异形胞的分化。许多受NtcA调控的基因都至少有一个保守的NtcA结合位点GTA-N8-TAC。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC7120基因alr1390可能的转录起始位点的上游有一个保守的NtcA结合位点GTA-TAGTTTTC-TAC。【目的】为了鉴定alr1390和NtcA之间的关系,【方法】采用实时定量反转录PCR实验(Real-time RT-PCR)和电泳迁移率实验(Electrophoretic mobility shift assays,EMSA)对alr1390和NtcA之间的关系进行了分析。【结果】Real-timeRT-PCR结果显示,alr1390的转录水平在野生型鱼腥蓝细菌PCC7120中缺氮诱导后和诱导前持平,而在ntcA突变体中缺氮诱导12h后呈现上调趋势。但是EMSA实验中没有检测到明显的NtcA和alr1390启动子区片段结合的滞后带,却观察到一条拖带。【结论】这说明alr1390受到NtcA的调控。
- 刘梦滢王莉陈雯莉
- 关键词：MOBILITYSHIFT
