沈阳市科技攻关计划项目(1081191-3-00)
- 作品数：3 被引量：14H指数：2
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- 发文基金：沈阳市科技攻关计划项目中国博士后科学基金辽宁省科技厅科技攻关项目更多>>
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- 分子标记技术在玉米大斑病抗性基因研究中的应用被引量：3
- 2009年
- 分子标记技术是植物抗性基因研究的重要手段之一。简要介绍了目前常用的几种DNA分子标记技术。论述了玉米大斑病抗性基因的来源及抗性表现,其中受显性基因控制的质量抗性基因有Ht1、Ht2、Ht3和HtN;玉米大斑病数量抗性基因涉及12条染色体,对大斑病各生理小种均有效。分别阐述了对玉米大斑病质量抗性基因和数量抗性基因的定位,并对分子标记技术在今后的应用进行了展望。
- 鄂洋林凤
- 关键词：玉米大斑病分子标记抗性基因
- 玉米大斑病抗性基因Ht1定位区域内候选序列的生物信息学分析被引量：9
- 2009年
- 为获得玉米大斑病抗性基因Ht1候选序列,文章采用生物信息学方法对与玉米大斑病抗性基因Ht1紧密连锁的分子标记umc22和umc122定位区域内候选序列进行了分析,其中得到的63条ORF序列中有14条序列可编码蛋白质结构域。将14条核苷酸酸序列预测出的氨基酸序列与已克隆的24条抗性基因编码氨基酸序列进行Blast比对及进化树构建。结果发现,候选序列gpm565a具有植物抗性基因编码产物的高度保守结构域,而且与抗性基因Xal相似性高、亲缘关系近,推测可能与抗性基因Ht1有关。其他候选序列由于不具有植物抗性基因编码产物的高度保守结构域或者相似性低、亲缘关系远等原因,不能确定与抗性基因Ht1有关。通过对候选序列gpm565a进行二级结构及三维结构分析,发现有大量构成蛋白质特异功能结构组件的无规则卷曲存在,推测gpm565a可能是Ht1功能域的一部分。
- 鄂洋林凤张春宇崔娜许玉凤
- 关键词：玉米大斑病抗性基因
- 玉米大斑病抗性基因Ht2定位区域内候选序列的生物信息学分析被引量：2
- 2009年
- 利用计算机技术对与玉米大斑病抗性基因Ht2紧密连锁的分子标记umc89和umc48a定位区域内全部序列进行生物信息学分析,共发现101条ORF序列,其中16条ORF序列可编码蛋白质结构域。将这16条序列与已克隆的23条抗病基因核苷酸序列进行BLAST比对及进化树构建,并分析其与已知抗病基因的相似性及亲缘关系。结果发现,序列pco115381g和pco110559-1与编码水稻白叶枯病基因Xa1相似性高、亲缘关系近,而且具有植物抗性基因的高度保守结构域特征,可能与玉米大斑病抗性基因Ht2有关。
- 武冰冰林凤张春雨崔娜许玉凤李楠孙权
- 关键词：玉米大斑病生物信息结构域
